190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0009 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0009  HAD family hydrolase  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.7922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3246  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  42.02 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4126  HAD family hydrolase  40.85 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.426997 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0235  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.34 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0448  HAD family hydrolase  40.79 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  42.44 
 
 		 238 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002114  2-haloalkanoic acid dehalogenase  40.93 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0326  HAD family hydrolase  42.16 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0394  HAD family hydrolase  41.15 
 
 		 237 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  41.03 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3630  HAD family hydrolase  39.92 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.23023  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  39.5 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0381  HAD family hydrolase  41.95 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0544  flavin mononucleotide phosphatase  39.92 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0208  flavin mononucleotide phosphatase  39.92 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.87823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4008  flavin mononucleotide phosphatase  39.92 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  38.91 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  37.82 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  38.49 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.6 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0104241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4163  flavin mononucleotide phosphatase  37.39 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0664113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  41.6 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  41.6 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  41.6 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3579  HAD family hydrolase  38.66 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3972  flavin mononucleotide phosphatase  38.24 
 
 		 238 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  38.66 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0394  HAD family hydrolase  39.92 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.742818  normal  0.409848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3980  flavin mononucleotide phosphatase  37.39 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0228084  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0395  HAD family hydrolase  39.92 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0490  HAD family hydrolase  40.17 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.714359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0186  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.5 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460375  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0126  flavin mononucleotide phosphatase  37.61 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00202  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant  34.15 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0079  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  32.16 
 
 		 257 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  33.76 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.56 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  35.84 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  35.24 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  34.07 
 
 		 231 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  34.07 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.48 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  32.6 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  33.19 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.44 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  32.52 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1771  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.44 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0442667  normal  0.7301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  30.33 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  29.07 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.33 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  30.85 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.68 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.53 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  26.84 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.41 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  30.35 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  30.65 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.17 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  28.97 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  28.21 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.4 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  29.3 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.56 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.43 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.56 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  32.14 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.4 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 		 227 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.6 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>