95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0005 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0005  cell division protein FtsN  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0377  sporulation domain-containing protein  46.5 
 
 
192 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0532  sporulation domain-containing protein  46.41 
 
 
188 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00323787  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0442  sporulation related  41.62 
 
 
185 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4428  sporulation domain-containing protein  43.17 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3763  sporulation domain-containing protein  38.27 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.007756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3780  sporulation domain-containing protein  43.17 
 
 
191 aa  131  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3358  sporulation related  39.29 
 
 
198 aa  131  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4190  sporulation related  44.44 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4367  putative cell division protein FtsN  45.21 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0494  sporulation domain-containing protein  36.54 
 
 
238 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0473  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 
238 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0497  Sporulation domain protein  34.62 
 
 
238 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3846  sporulation domain-containing protein  34.62 
 
 
238 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0549  sporulation domain-containing protein  36.24 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.45608  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0455  sporulation domain-containing protein  50.89 
 
 
231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3497  sporulation domain-containing protein  50.89 
 
 
231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4124  cell division protein FtsN, putative  51.79 
 
 
231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3674  sporulation domain-containing protein  50 
 
 
231 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03518  Sporulation related  44.9 
 
 
192 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.775864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2741  putative cell division protein FtsN  37.18 
 
 
189 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00725  hypothetical protein  36.11 
 
 
183 aa  99  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2249  putative cell division protein FtsN  40.4 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001747  cell division protein  48.42 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0114  cell division protein FtsN  38.94 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0114  cell division protein FtsN  38.94 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4102  cell division protein FtsN  38.94 
 
 
248 aa  79  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4791  cell division protein FtsN  33.96 
 
 
312 aa  64.7  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000221043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0167  cell division protein FtsN  32.71 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0181  cell division protein FtsN  32.71 
 
 
257 aa  64.3  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3796  cell division protein FtsN  39.19 
 
 
280 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0115  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
279 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2007  hypothetical protein  36.26 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2012  hypothetical protein  36.26 
 
 
231 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0819  sporulation domain-containing protein  28.73 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0831164  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4085  cell division protein FtsN  34.33 
 
 
284 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4052  cell division protein FtsN  34.33 
 
 
284 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4375  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.909645 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5390  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.653207  normal  0.982953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4469  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4165  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03818  essential cell division protein  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4415  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0743452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03767  hypothetical protein  34.33 
 
 
319 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4339  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
324 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4493  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
324 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4423  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
328 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4425  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
325 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4309  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
334 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4040  essential cell division protein FtsN  34.33 
 
 
344 aa  54.3  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2696  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  29.08 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193267  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4127  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 
207 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187687  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1124  cell division protein FtsN  32.14 
 
 
224 aa  48.5  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.1824  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0128  sporulation related  31.4 
 
 
260 aa  48.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0097  hypothetical protein  31.03 
 
 
246 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0472  Sporulation domain protein  29.33 
 
 
274 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.212039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2832  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
301 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1685  Sporulation domain protein  31.93 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2935  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
298 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6263  cell division protein  30.67 
 
 
301 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2306  sporulation related  30.67 
 
 
297 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2969  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2920  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 
297 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2455  sporulation related  28.8 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4246  hypothetical protein  29.33 
 
 
265 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0187  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 
265 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02917  hypothetical protein  36.62 
 
 
293 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2415  sporulation domain-containing protein  33.8 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45370  cell division protein FtsN  33.82 
 
 
264 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2783  putative FtsN cell division protein  31.76 
 
 
176 aa  44.7  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.892232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0354  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0591  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.809015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0429  cell division protein  29.33 
 
 
286 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2290  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1998  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.787505  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1976  sporulation domain-containing protein  31.62 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3098  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0085  sporulation repeat-containing protein  29.33 
 
 
282 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0409  cell division protein  29.33 
 
 
286 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446641  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2113  Sporulation domain protein  30.17 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4963  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0108  sporulation domain-containing protein  34.67 
 
 
248 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0375  sporulation domain-containing protein  30.56 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5140  sporulation domain-containing protein  30.26 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0910008  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0384  sporulation domain-containing protein  29.33 
 
 
292 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal  0.309068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  34.29 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0534  sporulation domain-containing protein  39.68 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5090  sporulation domain protein  30.26 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.153909  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0262  hypothetical protein  21.74 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0396  sporulation related  36.21 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5139  hypothetical protein  34.33 
 
 
231 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0246  Sporulation domain protein  23.57 
 
 
194 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.202943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0123  hypothetical protein  34.29 
 
 
248 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0279  Sporulation domain protein  33.8 
 
 
303 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3090  hypothetical protein  26.83 
 
 
213 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0401965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>