More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4259 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  100 
 
 		 208 aa  426  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 190 aa  72  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  34.55 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0474  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.542957  hitchhiker  4.20035e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0176  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  24.57 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.54 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.54 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>