More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4214 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 928 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 928 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 943 aa  706    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  55.54 
 
 		 949 aa  1075    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 891 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 915 aa  657    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  46.09 
 
 		 926 aa  836    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 944 aa  714    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 906 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 915 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 932 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  41.62 
 
 		 936 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  54.05 
 
 		 936 aa  1031    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 979 aa  664    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 922 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  39.59 
 
 		 925 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 928 aa  698    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 915 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 942 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 926 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.9 
 
 		 896 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  42.06 
 
 		 896 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 950 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 956 aa  664    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  43.57 
 
 		 928 aa  696    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 888 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  48.48 
 
 		 945 aa  867    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 941 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 978 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 877 aa  635    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  40 
 
 		 976 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 923 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.33 
 
 		 903 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  41.07 
 
 		 916 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 937 aa  660    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 891 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 932 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  42.48 
 
 		 945 aa  691    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 894 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40.93 
 
 		 924 aa  701    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 943 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 892 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 939 aa  674    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 893 aa  653    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 968 aa  669    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 926 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  43.63 
 
 		 922 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.56 
 
 		 937 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 915 aa  661    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 893 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 926 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 935 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.24 
 
 		 892 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 929 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 918 aa  643    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  42.9 
 
 		 926 aa  702    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  39.46 
 
 		 932 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 945 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 926 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 979 aa  702    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  43.1 
 
 		 921 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 937 aa  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 928 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  43.78 
 
 		 928 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 988 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 934 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 931 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 935 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 937 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.39 
 
 		 932 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 923 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 928 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 1043 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  58.13 
 
 		 946 aa  1115    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 930 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 934 aa  664    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  41.68 
 
 		 951 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  43.46 
 
 		 922 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  43.1 
 
 		 922 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  43.15 
 
 		 936 aa  723    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  43.69 
 
 		 918 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 930 aa  678    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 928 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 917 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 913 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  43.62 
 
 		 921 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 934 aa  670    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 926 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  43.51 
 
 		 921 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 928 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 933 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 911 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  43.62 
 
 		 922 aa  679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 1022 aa  676    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 893 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 946 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 892 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 923 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  44.17 
 
 		 923 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  42.53 
 
 		 930 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>