More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4183 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
568 aa  1163    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  46.15 
 
 
992 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.73 
 
 
1002 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.18 
 
 
1018 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  43.23 
 
 
990 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  41.02 
 
 
997 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  39.61 
 
 
971 aa  426  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.86 
 
 
953 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  42.09 
 
 
1012 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.04 
 
 
976 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  37.05 
 
 
1007 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  37.06 
 
 
966 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  34.6 
 
 
1003 aa  322  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  34.86 
 
 
585 aa  297  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 
583 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 
589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 
698 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.78 
 
 
591 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 
582 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.05 
 
 
573 aa  263  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  31.75 
 
 
624 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  30.52 
 
 
604 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.8 
 
 
600 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  31.6 
 
 
592 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  33.21 
 
 
537 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.13 
 
 
596 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.24 
 
 
534 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.24 
 
 
534 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  38.05 
 
 
542 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.21 
 
 
552 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 
543 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35.83 
 
 
656 aa  227  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
580 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.14 
 
 
558 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.59 
 
 
528 aa  224  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.17 
 
 
552 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 
543 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.72 
 
 
618 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  29.5 
 
 
631 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  28.57 
 
 
520 aa  213  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.6 
 
 
537 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  34.76 
 
 
427 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.64 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  37.63 
 
 
511 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 
444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  36.53 
 
 
538 aa  190  7e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  42.66 
 
 
498 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
426 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  31.63 
 
 
543 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  27.6 
 
 
845 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  39 
 
 
538 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.51 
 
 
365 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  41.28 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 
365 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  30.02 
 
 
699 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  30.21 
 
 
699 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 
365 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  33.76 
 
 
673 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  30.21 
 
 
699 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  34.42 
 
 
549 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.64 
 
 
511 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  29.98 
 
 
699 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  31.46 
 
 
420 aa  177  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 
633 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 
365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  28.42 
 
 
541 aa  172  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  37.41 
 
 
637 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
484 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.11 
 
 
520 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.09 
 
 
594 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.83 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.02 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  34.01 
 
 
378 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.54 
 
 
598 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.34 
 
 
492 aa  165  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.97 
 
 
688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  34.15 
 
 
544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  31.43 
 
 
734 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  27.9 
 
 
586 aa  163  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 
544 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.71 
 
 
504 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.83 
 
 
375 aa  161  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.94 
 
 
373 aa  160  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.07 
 
 
387 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  32.6 
 
 
375 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.24 
 
 
557 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.02 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  36.68 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  26.64 
 
 
528 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.85 
 
 
395 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 
468 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  32.82 
 
 
382 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.92 
 
 
490 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.98 
 
 
382 aa  150  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.25 
 
 
374 aa  149  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  33.7 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.65 
 
 
363 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.75 
 
 
530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  39.41 
 
 
475 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>