169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4115 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 429 aa  853    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  66.82 
 
 		 430 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  49.64 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  43.97 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  45.52 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  44.62 
 
 		 438 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.56 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.91 
 
 		 444 aa  345  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  47.2 
 
 		 441 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.17 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  44.36 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  45.37 
 
 		 426 aa  330  2e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.89 
 
 		 438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  42.76 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  44.07 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  42.62 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  46.32 
 
 		 408 aa  319  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  41.35 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  41.65 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41.4 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  40.63 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  40.63 
 
 		 432 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  40.41 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  40.41 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  40.18 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  40.18 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  39.19 
 
 		 432 aa  299  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  40.72 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  40.72 
 
 		 432 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  42.52 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  39.55 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  38.55 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  39.46 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  39.62 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  41.75 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  37.5 
 
 		 1140 aa  260  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  34.44 
 
 		 407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  31.38 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.86 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  33.25 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  31.25 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.63 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.11 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.71 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  32.92 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  32.47 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  32.47 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  34.31 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  33.9 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  33.42 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  34 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  32.08 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.8 
 
 		 428 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  31.37 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.63 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  32.92 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.08 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  32.68 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  30.84 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  31.19 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  31.97 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  31.06 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  31.42 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  32.19 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  34.18 
 
 		 408 aa  179  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.58 
 
 		 403 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  34.18 
 
 		 408 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.47 
 
 		 458 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  31.6 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  30.45 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  27.57 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.66 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  32.5 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.84 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.14 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  30.61 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 		 405 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.62 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  29.79 
 
 		 412 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  28.97 
 
 		 485 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  29.08 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  29.17 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  27.25 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  29.76 
 
 		 429 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  26.56 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  26.56 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  26.56 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  26.56 
 
 		 438 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30.24 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>