More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4081 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  81.01 
 
 		 180 aa  309  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  73.6 
 
 		 182 aa  294  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  75.57 
 
 		 187 aa  293  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  74.72 
 
 		 181 aa  293  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  75.98 
 
 		 181 aa  286  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.9 
 
 		 230 aa  196  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  54.55 
 
 		 168 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.63 
 
 		 183 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  49.37 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.04 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  54.48 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  48.75 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.38 
 
 		 183 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 		 182 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  47.59 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  52.45 
 
 		 184 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  49.69 
 
 		 184 aa  184  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.21 
 
 		 170 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.43 
 
 		 169 aa  184  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.21 
 
 		 170 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  49.06 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  49.06 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.78 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  49.36 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.55 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.55 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.55 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  52.47 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.08 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.85 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  51.03 
 
 		 226 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  52 
 
 		 183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.69 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  55.41 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.69 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  51.03 
 
 		 226 aa  180  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  52.11 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  48.72 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  46.51 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 		 193 aa  177  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.99 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  51.03 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.35 
 
 		 183 aa  177  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  48.72 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  50.7 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.59 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.1 
 
 		 792 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.74 
 
 		 791 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  46.79 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.42 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54.35 
 
 		 793 aa  175  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.69 
 
 		 794 aa  174  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.44 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.13 
 
 		 183 aa  174  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  47.13 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  56.15 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  53.1 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50.35 
 
 		 264 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  56.15 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 		 794 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  48.39 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.2 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  48.39 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.02 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  47.68 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  44.3 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  50.35 
 
 		 271 aa  171  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  47.74 
 
 		 159 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.08 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  46.53 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  47.74 
 
 		 159 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  48.98 
 
 		 172 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.68 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  51.08 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 		 170 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.99 
 
 		 787 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.47 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0101  NADH dehydrogenase subunit B  48.7 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0879346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  54.62 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  49.33 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.81 
 
 		 191 aa  168  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1690  NADH dehydrogenase subunit B  48.7 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1737  NADH dehydrogenase subunit B  48.7 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2861  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.31 
 
 		 213 aa  168  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0909969  hitchhiker  0.00517541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>