More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4050 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  69.85 
 
 
598 aa  873    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  52.19 
 
 
598 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  64.2 
 
 
599 aa  821    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 
614 aa  648    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
599 aa  1222    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 
611 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  73.45 
 
 
604 aa  902    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  68.52 
 
 
601 aa  863    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 
605 aa  665    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  52.25 
 
 
610 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  70.57 
 
 
598 aa  895    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  74.58 
 
 
604 aa  936    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
602 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  52.35 
 
 
600 aa  635    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
604 aa  643    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
602 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 
598 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
608 aa  636    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  51.93 
 
 
603 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 
603 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 
610 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 
603 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  51.68 
 
 
601 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  52.69 
 
 
600 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
601 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 
593 aa  645    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 
616 aa  635    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  71.31 
 
 
602 aa  889    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  69.71 
 
 
604 aa  866    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.37 
 
 
599 aa  656    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  53.24 
 
 
599 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 
608 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 
608 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.18 
 
 
601 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 
608 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 
608 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  52.54 
 
 
598 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 
606 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 
602 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 
610 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  52.45 
 
 
614 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  51.85 
 
 
600 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  52.11 
 
 
596 aa  626  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.48 
 
 
598 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  52.54 
 
 
598 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  52.37 
 
 
598 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  52.81 
 
 
592 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.48 
 
 
598 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.27 
 
 
610 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 
608 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  51.93 
 
 
604 aa  626  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  50.84 
 
 
600 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 
606 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  51 
 
 
613 aa  623  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  52.44 
 
 
609 aa  621  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 
603 aa  625  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 
609 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  50.84 
 
 
600 aa  622  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  51.37 
 
 
596 aa  622  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 
602 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  51.93 
 
 
608 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.45 
 
 
613 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 
605 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  51.18 
 
 
597 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
608 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 
608 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 
632 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
608 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  51.26 
 
 
608 aa  619  1e-176  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  51 
 
 
595 aa  619  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  52.3 
 
 
600 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
608 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4397  GTP-binding protein  51.09 
 
 
607 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  51.76 
 
 
603 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  50.59 
 
 
596 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 
605 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 
623 aa  616  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5317  GTP-binding protein  50.42 
 
 
607 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.818778  normal  0.46525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  50 
 
 
614 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4240  GTP-binding protein  50.92 
 
 
607 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.7005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  52.09 
 
 
608 aa  618  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>