247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3949 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  100 
 
 		 823 aa  1649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  42.67 
 
 		 830 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  39.43 
 
 		 830 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  39.26 
 
 		 800 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  41.7 
 
 		 812 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  37.53 
 
 		 824 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  39.89 
 
 		 846 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  35.44 
 
 		 791 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 834 aa  300  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  30.42 
 
 		 948 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 952 aa  294  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 833 aa  290  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 1055 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 936 aa  278  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 940 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.55 
 
 		 781 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 977 aa  272  2e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.04 
 
 		 827 aa  272  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 828 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 828 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  28.84 
 
 		 833 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 869 aa  252  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 837 aa  242  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  29.68 
 
 		 837 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.96 
 
 		 837 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 947 aa  226  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 852 aa  224  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.58 
 
 		 920 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 869 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.97 
 
 		 919 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.9 
 
 		 849 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 779 aa  197  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.05 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  26.66 
 
 		 915 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  30.29 
 
 		 931 aa  194  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 919 aa  194  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 920 aa  190  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 910 aa  187  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  26.1 
 
 		 897 aa  185  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 922 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 912 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.05 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  25.73 
 
 		 869 aa  179  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.56 
 
 		 921 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.4 
 
 		 877 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.3 
 
 		 877 aa  160  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.07 
 
 		 875 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  29.19 
 
 		 800 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.72 
 
 		 576 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.84 
 
 		 803 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 580 aa  143  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  43.92 
 
 		 425 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 992 aa  99.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.89 
 
 		 992 aa  93.6  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  24.27 
 
 		 587 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.62 
 
 		 703 aa  92  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.13 
 
 		 579 aa  91.3  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  24.4 
 
 		 603 aa  89.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 516 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 605 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.82 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.97 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  30.97 
 
 		 552 aa  80.9  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.17 
 
 		 552 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 537 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.18 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 558 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  33.52 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.98 
 
 		 552 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 392 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 387 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 392 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 387 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 393 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  27.54 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  27.54 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  27.54 
 
 		 558 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  30.17 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  30.17 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.73 
 
 		 609 aa  71.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  22.68 
 
 		 700 aa  71.2  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  30.41 
 
 		 333 aa  70.5  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.55 
 
 		 362 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 557 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 347 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  24.4 
 
 		 606 aa  70.5  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 565 aa  70.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  30.41 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.93 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.93 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>