More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3868 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  100 
 
 		 450 aa  895    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  63.07 
 
 		 442 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  48.56 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  41.72 
 
 		 448 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  41.08 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  39.78 
 
 		 477 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  38.61 
 
 		 491 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  40.18 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  38.61 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  38.61 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  38.61 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  38.61 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  38.61 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  38.61 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  38.46 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  39.16 
 
 		 491 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  38.88 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  36.87 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  36.89 
 
 		 475 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  37.64 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  39.31 
 
 		 444 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  39.1 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  38.24 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  39.46 
 
 		 464 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  37.09 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  37.76 
 
 		 485 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  37.95 
 
 		 468 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  35.37 
 
 		 477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  37.87 
 
 		 533 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  39.22 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  38.7 
 
 		 486 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  38.53 
 
 		 468 aa  279  9e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  38.58 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  37.64 
 
 		 475 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  36.64 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  38.23 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  36.12 
 
 		 497 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  36.42 
 
 		 463 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.72 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  36.72 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  35.53 
 
 		 544 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  36.91 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  38.34 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  38.43 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  35.51 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  37.34 
 
 		 487 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  37.09 
 
 		 452 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  35.93 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  36.13 
 
 		 480 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  38.51 
 
 		 468 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  36.77 
 
 		 448 aa  263  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  35.41 
 
 		 471 aa  262  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  36.44 
 
 		 474 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  38.44 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  36.58 
 
 		 482 aa  259  7e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  36.46 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  36.46 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  36.46 
 
 		 492 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  35.65 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  36.04 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  34.4 
 
 		 479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  35.49 
 
 		 476 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  33.33 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  32.56 
 
 		 504 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  33.85 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  36.18 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  36.18 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  34.26 
 
 		 479 aa  249  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.85 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  36.83 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  36.28 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  35.9 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  35.96 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  36.11 
 
 		 490 aa  246  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  37.09 
 
 		 494 aa  246  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  36.03 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  37.19 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  36.4 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.39 
 
 		 484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  36.01 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.78 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  36.36 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.53 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  32.95 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  32.52 
 
 		 480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  35.59 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  35.36 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  34.62 
 
 		 472 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  35.36 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  35.36 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  35.36 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  31.8 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  34.62 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  34.39 
 
 		 472 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.51 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.51 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  34.39 
 
 		 472 aa  240  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.51 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  34.39 
 
 		 472 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.51 
 
 		 464 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>