More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3859 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  74.04 
 
 		 428 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  874    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  72.99 
 
 		 424 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  69.91 
 
 		 425 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  73.33 
 
 		 431 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  72.71 
 
 		 433 aa  653    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  69.67 
 
 		 424 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  68.96 
 
 		 439 aa  626  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  67.7 
 
 		 422 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 435 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 436 aa  555  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  64.24 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  62.82 
 
 		 440 aa  550  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  63.53 
 
 		 438 aa  548  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  61.88 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 		 423 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.01 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 		 415 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 424 aa  484  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.79 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.06 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 		 413 aa  481  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 411 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 410 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 414 aa  475  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 417 aa  474  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.81 
 
 		 412 aa  474  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  56 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 437 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 410 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  55.48 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 427 aa  471  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 416 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  54.12 
 
 		 434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  54.69 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  52.98 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  54.93 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 432 aa  468  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  55.63 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  53.08 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>