More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3856 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 232 aa  481  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  46.9 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  45.37 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  42.22 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  42.36 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  38.57 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  37.22 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  39.91 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  36.48 
 
 		 269 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  35.81 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.82 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.43 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  35.02 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  33.82 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  37.9 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  34.33 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.11 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  38.93 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.89 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.77 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  37.84 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.47 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.89 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  31.98 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  38.71 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.8 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.37 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.63 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.57 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.36 
 
 		 245 aa  94.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.38 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.99 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.51 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  37.12 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  28.7 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.51 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.73 
 
 		 251 aa  91.7  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.56 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 220 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  30.04 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 264 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  32.85 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.47 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  40 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  31.54 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  31.22 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  35.03 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  35.03 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.69 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  30.29 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  34.39 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.54 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  28.7 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  30.64 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  32.68 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  29.39 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.65 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  30.77 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33.67 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.51 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  26.42 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.15 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>