More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3838 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  100 
 
 
429 aa  868  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  62.59 
 
 
418 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  35.01 
 
 
417 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  31.69 
 
 
412 aa  200  4e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  31.07 
 
 
407 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  30.5 
 
 
475 aa  183  4e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  30.62 
 
 
422 aa  174  2e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  31.02 
 
 
446 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  29.26 
 
 
431 aa  162  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  27.67 
 
 
419 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.75 
 
 
394 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  25.18 
 
 
436 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  25.66 
 
 
465 aa  119  8e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  33.18 
 
 
490 aa  115  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  25.83 
 
 
503 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  25.11 
 
 
495 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  24.21 
 
 
503 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  24.83 
 
 
516 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.8172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  25.18 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.40238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  26.98 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  26.21 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  25.64 
 
 
441 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.12 
 
 
428 aa  85.9  1e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.41 
 
 
440 aa  85.9  1e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  24.37 
 
 
381 aa  81.3  4e-14  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.44 
 
 
394 aa  80.1  7e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  23.92 
 
 
420 aa  76.6  8e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  26.13 
 
 
412 aa  75.9  1e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  22.94 
 
 
427 aa  74.7  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  22.59 
 
 
438 aa  74.3  3e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  23.17 
 
 
427 aa  74.7  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  22.94 
 
 
427 aa  73.9  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  22.94 
 
 
427 aa  73.9  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  26.81 
 
 
433 aa  73.6  6e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.36 
 
 
438 aa  72.4  1e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  22.57 
 
 
428 aa  72.8  1e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  34.72 
 
 
382 aa  72.8  1e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  22.94 
 
 
419 aa  72  2e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  23.11 
 
 
438 aa  72.4  2e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  22.99 
 
 
477 aa  70.9  5e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  22.71 
 
 
427 aa  70.5  5e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  22.71 
 
 
427 aa  70.5  5e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  22.71 
 
 
427 aa  70.5  5e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  22.71 
 
 
419 aa  70.5  6e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.2 
 
 
391 aa  70.5  6e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  22.71 
 
 
419 aa  70.1  6e-11  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  22.71 
 
 
419 aa  70.5  6e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  32.05 
 
 
455 aa  70.1  6e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  22.71 
 
 
419 aa  70.1  6e-11  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  23.57 
 
 
382 aa  70.1  7e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.56 
 
 
398 aa  69.7  8e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  23.11 
 
 
427 aa  70.1  8e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  24.28 
 
 
456 aa  69.3  1e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  24.28 
 
 
456 aa  69.3  1e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.28 
 
 
456 aa  68.9  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  22.94 
 
 
427 aa  68.6  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  24.04 
 
 
461 aa  66.6  7e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  31.78 
 
 
382 aa  66.6  7e-10  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  35.21 
 
 
405 aa  65.9  1e-09  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  23.91 
 
 
427 aa  65.5  2e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  23.91 
 
 
424 aa  65.5  2e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  30.71 
 
 
387 aa  65.5  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  27.14 
 
 
410 aa  64.7  3e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  33.85 
 
 
323 aa  64.7  3e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.12 
 
 
372 aa  64.7  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.79 
 
 
404 aa  64.3  4e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  32.14 
 
 
405 aa  64.3  4e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.31 
 
 
375 aa  63.5  6e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  22.83 
 
 
379 aa  62.8  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  33.33 
 
 
387 aa  62.8  1e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  27.75 
 
 
420 aa  62.4  2e-08  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  24.35 
 
 
398 aa  62.4  2e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  25.34 
 
 
387 aa  61.2  3e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  37.27 
 
 
256 aa  60.8  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  25.84 
 
 
448 aa  60.8  5e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.43 
 
 
397 aa  60.5  6e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  32.58 
 
 
377 aa  60.5  6e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  32.58 
 
 
377 aa  60.5  6e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  28.05 
 
 
376 aa  60.1  7e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  37.29 
 
 
447 aa  59.7  1e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.2 
 
 
366 aa  59.3  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  26.74 
 
 
433 aa  59.3  1e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  32.28 
 
 
404 aa  59.7  1e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  30.23 
 
 
372 aa  59.7  1e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.38 
 
 
472 aa  59.3  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  30.38 
 
 
472 aa  59.3  1e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  21.3 
 
 
397 aa  58.5  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  31.45 
 
 
307 aa  58.5  2e-07  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  32.67 
 
 
633 aa  58.2  3e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  32.38 
 
 
327 aa  57.8  3e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 
484 aa  58.2  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  31.82 
 
 
344 aa  58.2  3e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.26 
 
 
430 aa  58.2  3e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  30.53 
 
 
362 aa  57.8  4e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  30.53 
 
 
362 aa  57.8  4e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27.09 
 
 
378 aa  57.8  4e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.53 
 
 
362 aa  57.8  4e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  29.13 
 
 
417 aa  57.4  5e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  33.6 
 
 
610 aa  57.4  5e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  34.13 
 
 
440 aa  57.4  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>