191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3782 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  100 
 
 
249 aa  494  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  42.74 
 
 
234 aa  172  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  42.31 
 
 
234 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  40.24 
 
 
236 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  42.86 
 
 
235 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  46.05 
 
 
235 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  41.45 
 
 
234 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  41.45 
 
 
234 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  41.6 
 
 
235 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  41.06 
 
 
236 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  41.45 
 
 
234 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  41.45 
 
 
234 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  41.06 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  41.06 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  40.76 
 
 
235 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  39.43 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  38.59 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  41.03 
 
 
237 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  40 
 
 
235 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  39.27 
 
 
240 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_002950  PG0795  hypothetical protein  38.66 
 
 
236 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  41.15 
 
 
244 aa  156  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  36.95 
 
 
234 aa  154  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  43.69 
 
 
219 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  42.08 
 
 
246 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  38.49 
 
 
235 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  39.17 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  42.08 
 
 
246 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  35.51 
 
 
233 aa  151  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  42.08 
 
 
246 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  39.48 
 
 
232 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  48.28 
 
 
233 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  38.72 
 
 
232 aa  149  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  46.45 
 
 
247 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  44.25 
 
 
224 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  44.25 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  46.67 
 
 
256 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  38.17 
 
 
242 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  38.43 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  38.43 
 
 
234 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  37.66 
 
 
256 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  38.86 
 
 
259 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  38.96 
 
 
252 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  41.29 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  38.86 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3648  protein of unknown function UPF0005  34.14 
 
 
241 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000291773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  43.48 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  39.63 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  36.17 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  39.04 
 
 
245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  41.53 
 
 
240 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  36.73 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  37.92 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  42.7 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  36.4 
 
 
245 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  40.98 
 
 
238 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  41.67 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  39.09 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  39.55 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  38.34 
 
 
236 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  37.92 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  40.51 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  41.62 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  41.08 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  37.14 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  40 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  37.5 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  39.04 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  41.05 
 
 
242 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  36.15 
 
 
240 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  34.76 
 
 
228 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  124  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  41.08 
 
 
274 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  39.04 
 
 
241 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  43.41 
 
 
237 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  43.41 
 
 
237 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  43.41 
 
 
236 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  42.54 
 
 
261 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  39.89 
 
 
236 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2141  hypothetical protein  45.91 
 
 
232 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  40.66 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  38.8 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  39.56 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  32.27 
 
 
250 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1249  hypothetical protein  35.34 
 
 
237 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000770984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  39.41 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  40.59 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  39.23 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  39.39 
 
 
271 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  39.78 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  39.41 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1502  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.13 
 
 
243 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.230664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>