More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3766 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  100 
 
 
492 aa  987  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  48.18 
 
 
497 aa  461  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
499 aa  453  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  9.63677e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 
499 aa  454  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  46.22 
 
 
499 aa  453  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.71 
 
 
506 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.23 
 
 
517 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
497 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.97 
 
 
496 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
496 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  7.61209e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
496 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  42.33 
 
 
513 aa  418  1e-115  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.38 
 
 
514 aa  418  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.38 
 
 
514 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.38 
 
 
514 aa  418  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  43.78 
 
 
512 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1986  ABC transporter related  42.51 
 
 
501 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437257  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  42.28 
 
 
499 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
504 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.78 
 
 
501 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  42.8 
 
 
509 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  42.28 
 
 
499 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  43 
 
 
495 aa  405  1e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.41 
 
 
492 aa  405  1e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.57 
 
 
514 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  41.96 
 
 
511 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.94 
 
 
517 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
498 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.55 
 
 
515 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  40.94 
 
 
509 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  42.16 
 
 
516 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  42.94 
 
 
507 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  41.87 
 
 
493 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 
508 aa  400  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.68 
 
 
506 aa  399  1e-110  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.75 
 
 
494 aa  399  1e-110  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  40.77 
 
 
495 aa  401  1e-110  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.94 
 
 
501 aa  400  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  43.26 
 
 
503 aa  401  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.38 
 
 
517 aa  399  1e-110  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.55 
 
 
520 aa  399  1e-110  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 
516 aa  400  1e-110  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  41.13 
 
 
512 aa  400  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 
506 aa  401  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  43.37 
 
 
506 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0343  ABC transporter related  42.95 
 
 
497 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.95 
 
 
497 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
511 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  40.94 
 
 
506 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  4.97905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
504 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.95 
 
 
511 aa  398  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  41.06 
 
 
516 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 
492 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  41.38 
 
 
499 aa  395  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  43.09 
 
 
506 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  43.29 
 
 
495 aa  392  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
501 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.77 
 
 
506 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 
505 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  41.88 
 
 
505 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  43.09 
 
 
528 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.2 
 
 
519 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.55 
 
 
525 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 
504 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2078  ABC transporter related  42.8 
 
 
503 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529914 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.37 
 
 
501 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.98 
 
 
511 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  43.91 
 
 
521 aa  392  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  40.84 
 
 
515 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
505 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.18 
 
 
500 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.76 
 
 
511 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.82 
 
 
523 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.88 
 
 
500 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  43.47 
 
 
525 aa  391  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.46 
 
 
497 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.46 
 
 
508 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.09 
 
 
513 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2443  ABC transporter related  41.34 
 
 
494 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  40.93 
 
 
518 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.51 
 
 
513 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  41.65 
 
 
496 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.33 
 
 
506 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.9 
 
 
509 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
525 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  42.89 
 
 
506 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  42.31 
 
 
499 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  43.58 
 
 
500 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  42.89 
 
 
506 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 
506 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.72 
 
 
524 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  42.89 
 
 
506 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
515 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.12 
 
 
507 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.47 
 
 
496 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.04 
 
 
502 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  40.73 
 
 
508 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.49 
 
 
504 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 
507 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  41.16 
 
 
496 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>