More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3730 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 440 aa  892    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  53.16 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  51.82 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  47.16 
 
 		 543 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  47.16 
 
 		 544 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.11 
 
 		 294 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.17 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  43.12 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.7 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  28.28 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40 
 
 		 344 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.62 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.62 
 
 		 350 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.62 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.83 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  42.41 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40 
 
 		 344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  40.7 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40.56 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.74 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.74 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.74 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.75 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.38 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.49 
 
 		 237 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  40.57 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  43.23 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.79 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.77 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  46.73 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.63 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 240 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  36.88 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.25 
 
 		 375 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.25 
 
 		 375 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.75 
 
 		 320 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  48.11 
 
 		 694 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 506 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.9 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.37 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  33.22 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.24 
 
 		 623 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 239 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 209 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  38.18 
 
 		 187 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.99 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.51 
 
 		 231 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 1026 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.22 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  38.04 
 
 		 189 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 198 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 537 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  50.94 
 
 		 236 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 239 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.79 
 
 		 620 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  45.37 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.75 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.98 
 
 		 637 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 222 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.61 
 
 		 230 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  38.99 
 
 		 386 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 231 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  38.71 
 
 		 380 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 220 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  36.31 
 
 		 352 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 190 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.55 
 
 		 264 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1987 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 		 193 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  47.12 
 
 		 225 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  45.54 
 
 		 277 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  42.59 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.08 
 
 		 266 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  35.12 
 
 		 196 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 		 727 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  34.55 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  41.67 
 
 		 533 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  37.58 
 
 		 1264 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.36 
 
 		 412 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.5 
 
 		 219 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>