More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3686 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  100 
 
 		 142 aa  287  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  52.82 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  52.82 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  52.11 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  51.39 
 
 		 146 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  55.12 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  50.35 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  51.05 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  49.65 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  52.52 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  49.3 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  51.06 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  49.65 
 
 		 146 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  51.06 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  50.35 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  48.57 
 
 		 143 aa  140  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  49.65 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  46.9 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  48.25 
 
 		 146 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  49.3 
 
 		 147 aa  138  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  48.59 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  47.89 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  48.94 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  45.07 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  45.45 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  47.92 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  45.45 
 
 		 145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  51.05 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  46.81 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  48.23 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  50.85 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  46.1 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  46.81 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  45.07 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  45.45 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  43.06 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  43.97 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  42.25 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  43.97 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  50.96 
 
 		 104 aa  120  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  36.03 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  31.69 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  34.29 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  31.43 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  39.34 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  36.11 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1391  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.769563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  32.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  38.28 
 
 		 182 aa  88.6  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  32.62 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  29.93 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  30.66 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2961  CBS domain-containing proteins  35.97 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.195076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  31.39 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  31.39 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.91 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1607  signal-transduction protein  35.97 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0484541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  34.29 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  31.21 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  31.65 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.04 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  30 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  34.06 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  31.88 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>