More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3605 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 188 aa  167  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  44.71 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  43.1 
 
 		 265 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 188 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  38.29 
 
 		 192 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  35.66 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.57 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 186 aa  88.6  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  35.56 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  35.97 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 191 aa  86.3  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 		 179 aa  85.1  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  29.24 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  31.79 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  34.39 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  25.73 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  33.71 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 212 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  29.52 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  29.24 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0433  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00447599  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  26.74 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  25.41 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1043  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.391418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2234  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>