More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3596 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  45.7 
 
 		 1150 aa  927    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  39.33 
 
 		 1040 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  49.76 
 
 		 1051 aa  1001    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  45.57 
 
 		 1152 aa  875    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  49.71 
 
 		 1163 aa  961    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  51.29 
 
 		 1028 aa  1025    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  48.62 
 
 		 1132 aa  974    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  37.29 
 
 		 1053 aa  644    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  45.69 
 
 		 1096 aa  891    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1059 aa  2144    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  44.93 
 
 		 1154 aa  873    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1161 aa  629  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 1080 aa  619  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 1037 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  36.52 
 
 		 1049 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  35.28 
 
 		 1038 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  34.6 
 
 		 1114 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1155 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  34.46 
 
 		 1029 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.71 
 
 		 1041 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 		 1116 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 1063 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1177 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1117 aa  553  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1071 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1124 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1006 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1154 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  32.42 
 
 		 1021 aa  535  1e-150  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  34.69 
 
 		 1080 aa  531  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 1000 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  33.27 
 
 		 1181 aa  532  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 1066 aa  532  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.59 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 1019 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 1097 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 989 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 1012 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1006 aa  509  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 1076 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1008 aa  503  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 986 aa  497  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1148 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1023 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  32.24 
 
 		 1063 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1128 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1076 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.6 
 
 		 1173 aa  492  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1039 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1076 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 979 aa  488  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1010 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1027 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1122 aa  483  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 1071 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 		 1079 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  31.28 
 
 		 1018 aa  478  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 994 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.88 
 
 		 1023 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 1025 aa  479  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1050 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 982 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 1103 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1096 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.66 
 
 		 1129 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 996 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1075 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  31.27 
 
 		 1077 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1177 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 1034 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1079 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1066 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.23 
 
 		 1024 aa  452  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1014 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1023 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1060 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1081 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1052 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1014 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 999 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 1038 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 1147 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 1043 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 1140 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.76 
 
 		 996 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1164 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  31.98 
 
 		 1102 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1041 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1026 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1036 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1071 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  30.42 
 
 		 1119 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.12 
 
 		 1019 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 		 1002 aa  426  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1013 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1113 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1017 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>