More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3566 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  855    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  61.58 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  53.23 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 420 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 850 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 410 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 422 aa  268  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 416 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  31 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 506 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.52 
 
 		 426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 405 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  29.11 
 
 		 449 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 578 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29.74 
 
 		 446 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 444 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.32 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.33 
 
 		 475 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  27.07 
 
 		 453 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 429 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  26.13 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.69 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  26.36 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  26.36 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  26.36 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  26.16 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  26.16 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  26.15 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  26.18 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 542 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  28 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  26.18 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  26.18 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  26.18 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  26.18 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  26.33 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 453 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 431 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 424 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.06 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  25.97 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.18 
 
 		 436 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.62 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>