More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3535 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3535  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 544 aa  1126    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4041  extracellular solute-binding protein family 5  49.91 
 
 		 543 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457031  normal  0.172562 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09061  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  46.98 
 
 		 538 aa  497  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.593779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  34.07 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 		 544 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  33.99 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1498  hypothetical protein  30.43 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1502  hypothetical protein  30.43 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  28.92 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 535 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  28.57 
 
 		 535 aa  193  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.59 
 
 		 540 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28 
 
 		 545 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.26 
 
 		 532 aa  188  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 538 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 		 540 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.59 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.83 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  26.75 
 
 		 530 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 		 590 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  27.66 
 
 		 594 aa  180  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 531 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.43 
 
 		 521 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.43 
 
 		 521 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.43 
 
 		 521 aa  177  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.43 
 
 		 521 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 521 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 531 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 538 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.6 
 
 		 520 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 545 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 534 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 530 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.6 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.16 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  26.5 
 
 		 532 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 558 aa  170  8e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6676  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.479975  normal  0.420932 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  24.16 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  27.5 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.91 
 
 		 513 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  27.41 
 
 		 541 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  26.74 
 
 		 534 aa  167  5e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 532 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.89 
 
 		 528 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  25.1 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  25.97 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 622 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.15 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.9 
 
 		 512 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.8 
 
 		 538 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.71 
 
 		 512 aa  163  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.71 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  24.71 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  26.94 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  25.99 
 
 		 544 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  26.97 
 
 		 542 aa  161  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1461  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 542 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0157801  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  24.52 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.45 
 
 		 528 aa  160  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.75 
 
 		 493 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0334  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.768653  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  24.95 
 
 		 512 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.71 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.58 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  26 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  24.75 
 
 		 512 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 		 530 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1954  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.58 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0666582  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 528 aa  156  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0091  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0584  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.542939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2283  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.48 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0708849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2005  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0402  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>