More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3422 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03652  ketol-acid reductoisomerase  70.99 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0412359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4202  ketol-acid reductoisomerase  70.99 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4191  ketol-acid reductoisomerase  69.98 
 
 		 491 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4146  ketol-acid reductoisomerase  70.79 
 
 		 491 aa  707    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0441  ketol-acid reductoisomerase  68.16 
 
 		 493 aa  705    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4228  ketol-acid reductoisomerase  70.99 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4010  ketol-acid reductoisomerase  69.57 
 
 		 492 aa  722    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4839  ketol-acid reductoisomerase  68.56 
 
 		 493 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0087  ketol-acid reductoisomerase  70.67 
 
 		 494 aa  711    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4349  ketol-acid reductoisomerase  68.98 
 
 		 492 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2550  ketol-acid reductoisomerase  71.89 
 
 		 494 aa  720    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.393335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3846  ketol-acid reductoisomerase  78.37 
 
 		 490 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30642  decreased coverage  0.000000000809621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3422  ketol-acid reductoisomerase  100 
 
 		 493 aa  1022    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000227916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0493  ketol-acid reductoisomerase  69.64 
 
 		 492 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.195058  normal  0.0261398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0163  ketol-acid reductoisomerase  69.84 
 
 		 492 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4021  ketol-acid reductoisomerase  70.45 
 
 		 492 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3768  ketol-acid reductoisomerase  70.04 
 
 		 492 aa  696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2518  ketol-acid reductoisomerase  72.75 
 
 		 490 aa  742    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4140  ketol-acid reductoisomerase  70.79 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0447832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4119  ketol-acid reductoisomerase  70.18 
 
 		 491 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3935  ketol-acid reductoisomerase  69.17 
 
 		 492 aa  721    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4166  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 493 aa  694    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1483  ketol-acid reductoisomerase  72.54 
 
 		 490 aa  740    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03601  hypothetical protein  70.99 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5208  ketol-acid reductoisomerase  70.59 
 
 		 491 aa  707    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3990  ketol-acid reductoisomerase  70.99 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4129  ketol-acid reductoisomerase  69.17 
 
 		 492 aa  720    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4032  ketol-acid reductoisomerase  69.37 
 
 		 492 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4285  ketol-acid reductoisomerase  70.79 
 
 		 491 aa  708    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2860  ketol-acid reductoisomerase  77.76 
 
 		 489 aa  803    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.673164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0344  ketol-acid reductoisomerase  67.55 
 
 		 493 aa  695    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3415  ketol-acid reductoisomerase  66.73 
 
 		 492 aa  696    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0146  ketol-acid reductoisomerase  69.64 
 
 		 492 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4009  ketol-acid reductoisomerase  70.39 
 
 		 491 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0176086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4255  ketol-acid reductoisomerase  68.42 
 
 		 494 aa  706    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1149  ketol-acid reductoisomerase  83.27 
 
 		 492 aa  860    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0733267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1671  ketol-acid reductoisomerase  66.4 
 
 		 493 aa  661    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4751  ketol-acid reductoisomerase  69.37 
 
 		 491 aa  690    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0361  ketol-acid reductoisomerase  68.78 
 
 		 492 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3665  ketol-acid reductoisomerase  68.98 
 
 		 492 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0421  ketol-acid reductoisomerase  68.15 
 
 		 493 aa  704    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001983  ketol-acid reductoisomerase  71.69 
 
 		 494 aa  724    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04021  ketol-acid reductoisomerase  70.26 
 
 		 492 aa  722    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4213  ketol-acid reductoisomerase  69.64 
 
 		 492 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00478  ketol-acid reductoisomerase  71.89 
 
 		 514 aa  725    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4134  ketol-acid reductoisomerase  69.98 
 
 		 491 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4299  ketol-acid reductoisomerase  70.18 
 
 		 491 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0355  ketol-acid reductoisomerase  68.78 
 
 		 492 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2758  ketol-acid reductoisomerase  72.34 
 
 		 490 aa  740    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.302055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4051  ketol-acid reductoisomerase  69.84 
 
 		 492 aa  694    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3282  ketol-acid reductoisomerase  68.56 
 
 		 493 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3615  ketol-acid reductoisomerase  69.18 
 
 		 492 aa  719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0853  ketol-acid reductoisomerase  72.41 
 
 		 493 aa  757    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0288  ketol-acid reductoisomerase  68.78 
 
 		 493 aa  704    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4240  ketol-acid reductoisomerase  69.98 
 
 		 491 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0116  ketol-acid reductoisomerase  37.15 
 
 		 359 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0812  ketol-acid reductoisomerase  35.11 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1061  ketol-acid reductoisomerase  35.6 
 
 		 338 aa  177  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1262  ketol-acid reductoisomerase  38 
 
 		 338 aa  177  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.085544  hitchhiker  0.0000000293611 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0529  ketol-acid reductoisomerase  33.44 
 
 		 338 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2226  ketol-acid reductoisomerase  34.37 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0524  ketol-acid reductoisomerase  33.44 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.181387  normal  0.0101595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1903  ketol-acid reductoisomerase  34.37 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.276758  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1900  ketol-acid reductoisomerase  33.44 
 
 		 338 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.119267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0913  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  173  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0544  ketol-acid reductoisomerase  36.42 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  hitchhiker  0.00154571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2555  ketol-acid reductoisomerase  38.59 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00688273  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2371  ketol-acid reductoisomerase  33.86 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0611  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3416  ketol-acid reductoisomerase  38.72 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3718  ketol-acid reductoisomerase  37.17 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193643  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08830  ketol-acid reductoisomerase  35.53 
 
 		 331 aa  171  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.334822  normal  0.238181 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1719  ketol-acid reductoisomerase  33.64 
 
 		 338 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00792328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2075  ketol-acid reductoisomerase  34.06 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0472  ketol-acid reductoisomerase  34.98 
 
 		 338 aa  170  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0949  ketol-acid reductoisomerase  34.17 
 
 		 338 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2775  ketol-acid reductoisomerase  33.33 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3341  ketol-acid reductoisomerase  37.54 
 
 		 339 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.764687  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0948  ketol-acid reductoisomerase  33.12 
 
 		 340 aa  167  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.525725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0900  ketol-acid reductoisomerase  33.76 
 
 		 338 aa  167  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1641  ketol-acid reductoisomerase  34.9 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.75245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5327  ketol-acid reductoisomerase  37.21 
 
 		 339 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1909  ketol-acid reductoisomerase  37.29 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0381319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42500  ketol-acid reductoisomerase  33.55 
 
 		 338 aa  166  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0329  ketol-acid reductoisomerase  35.06 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0541  ketol-acid reductoisomerase  33.54 
 
 		 340 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0469  ketol-acid reductoisomerase  36.5 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0285  ketol-acid reductoisomerase  35.06 
 
 		 339 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.772607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3228  ketol-acid reductoisomerase  34.77 
 
 		 337 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0739  ketol-acid reductoisomerase  35.02 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.575656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13016  ketol-acid reductoisomerase  34.6 
 
 		 333 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00176679  normal  0.164078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2501  ketol-acid reductoisomerase  35.86 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000349706  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1927  ketol-acid reductoisomerase  34.5 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2319  ketol-acid reductoisomerase  33.54 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.73852 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2466  ketol-acid reductoisomerase  37.71 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.4902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0983  ketol-acid reductoisomerase  34.17 
 
 		 338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.900438  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2102  ketol-acid reductoisomerase  35.37 
 
 		 339 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3073  ketol-acid reductoisomerase  34.9 
 
 		 338 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2156  ketol-acid reductoisomerase  34.52 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1541  ketol-acid reductoisomerase  35.76 
 
 		 327 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>