177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3399 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
613 aa  1276    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  52.01 
 
 
905 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.35 
 
 
634 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.25 
 
 
766 aa  538  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.92 
 
 
790 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.74 
 
 
609 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.41 
 
 
618 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.25 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.71 
 
 
613 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.39 
 
 
762 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  45.54 
 
 
777 aa  466  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.81 
 
 
795 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.54 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.24 
 
 
779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.43 
 
 
775 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.6 
 
 
779 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.98 
 
 
772 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.92 
 
 
533 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.5 
 
 
774 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.6 
 
 
785 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.79 
 
 
781 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.52 
 
 
776 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  38.02 
 
 
795 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.17 
 
 
526 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.22 
 
 
549 aa  394  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.06 
 
 
605 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.37 
 
 
618 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.4 
 
 
765 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.18 
 
 
834 aa  357  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.33 
 
 
534 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.14 
 
 
527 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.19 
 
 
655 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  36.79 
 
 
736 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.87 
 
 
760 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.75 
 
 
812 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.71 
 
 
821 aa  342  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.19 
 
 
812 aa  333  6e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  40 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.76 
 
 
546 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.5 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  40.45 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 
628 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.74 
 
 
549 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.57 
 
 
529 aa  297  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.97 
 
 
639 aa  297  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
525 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.01 
 
 
665 aa  293  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36 
 
 
614 aa  291  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.68 
 
 
636 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.08 
 
 
639 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.67 
 
 
545 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  34.1 
 
 
602 aa  286  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.99 
 
 
422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 
639 aa  277  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 
636 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.23 
 
 
639 aa  272  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.78 
 
 
481 aa  266  7e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 
547 aa  262  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 
543 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.06 
 
 
688 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.85 
 
 
627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
683 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.65 
 
 
533 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 
447 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.24 
 
 
525 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.13 
 
 
558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.26 
 
 
816 aa  238  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
493 aa  237  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.5 
 
 
688 aa  236  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.74 
 
 
858 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
794 aa  233  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.58 
 
 
584 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.41 
 
 
593 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.3 
 
 
528 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.96 
 
 
673 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 
515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
518 aa  225  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.75 
 
 
676 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.74 
 
 
811 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.6 
 
 
797 aa  221  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 
673 aa  220  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 
807 aa  220  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 
504 aa  211  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.84 
 
 
863 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.8 
 
 
852 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.69 
 
 
778 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.32 
 
 
868 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.62 
 
 
866 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.32 
 
 
1140 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.24 
 
 
820 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
500 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.9 
 
 
489 aa  183  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.06 
 
 
857 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.63 
 
 
530 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.84 
 
 
885 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.39 
 
 
913 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
910 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.9 
 
 
884 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.62 
 
 
913 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>