More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3394 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  82.44 
 
 
426 aa  679  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
408 aa  817  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  56.19 
 
 
408 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  58.31 
 
 
405 aa  445  1e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  48.89 
 
 
428 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  46.6 
 
 
421 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
414 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 
414 aa  332  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  45.32 
 
 
412 aa  331  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  41.52 
 
 
419 aa  315  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  41.33 
 
 
421 aa  312  5e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  39.35 
 
 
422 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  44.85 
 
 
406 aa  310  3e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 
428 aa  308  2e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  43.29 
 
 
430 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  41.6 
 
 
399 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  40.05 
 
 
424 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  44.75 
 
 
415 aa  289  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  38.63 
 
 
405 aa  289  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
407 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  41.58 
 
 
419 aa  284  2e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 
401 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  41.56 
 
 
412 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  38.75 
 
 
405 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  40.66 
 
 
406 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  41.49 
 
 
406 aa  275  9e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  42.05 
 
 
406 aa  272  8e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  38.89 
 
 
415 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 
406 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  39.81 
 
 
426 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.11783e-05  unclonable  7.56922e-10 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
427 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.52958e-05  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  39.32 
 
 
428 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  4.34229e-07  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  40.29 
 
 
397 aa  245  1e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  41.13 
 
 
424 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  41.13 
 
 
424 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  41.13 
 
 
399 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  41.21 
 
 
434 aa  239  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  38.1 
 
 
436 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  39.44 
 
 
397 aa  235  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  39.44 
 
 
397 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  37.9 
 
 
397 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  39.71 
 
 
399 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  39.71 
 
 
399 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  39.71 
 
 
399 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  39.78 
 
 
418 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  36.48 
 
 
411 aa  220  4e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
398 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  37.23 
 
 
412 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 
397 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  37.93 
 
 
395 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  41.21 
 
 
422 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  32.27 
 
 
401 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  37.6 
 
 
395 aa  197  2e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  35.33 
 
 
408 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
402 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
411 aa  191  3e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.09307e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  37.06 
 
 
413 aa  185  1e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  32.61 
 
 
414 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  33.98 
 
 
391 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  34.7 
 
 
396 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  31.97 
 
 
411 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.33 
 
 
414 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  31.06 
 
 
411 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  36.66 
 
 
429 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1794  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1708  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.477199  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0121  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1119  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1290  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800676  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0305  multidrug resistance protein  36.39 
 
 
429 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  31.69 
 
 
411 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  30.77 
 
 
416 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  34.24 
 
 
412 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
398 aa  165  1e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34.34 
 
 
398 aa  164  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
398 aa  165  2e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  34.35 
 
 
396 aa  163  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
389 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  33.99 
 
 
386 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  31.56 
 
 
407 aa  156  5e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.14988e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2330  major facilitator transporter  31.96 
 
 
411 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  32.42 
 
 
417 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  31.22 
 
 
413 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
387 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.58317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
439 aa  148  2e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  34.51 
 
 
419 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
425 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
434 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.34 
 
 
416 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.25 
 
 
424 aa  144  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
424 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1298  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 
402 aa  141  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.148337  normal  0.167522 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
423 aa  141  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
392 aa  140  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  34.13 
 
 
435 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1598  transporter, major facilitator superfamily and tetracycline resistance protein  28.8 
 
 
366 aa  139  9e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 
422 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
421 aa  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  32.37 
 
 
370 aa  135  1e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>