More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3389 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  53.65 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  50.78 
 
 		 189 aa  204  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  50 
 
 		 190 aa  201  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  53.55 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  52.3 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  45.78 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  44.25 
 
 		 175 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  42.53 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  41.5 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  38.98 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  40.7 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  42.37 
 
 		 177 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  41.81 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.15 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  46.94 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  41.81 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  38.37 
 
 		 180 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  39.23 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  37.29 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  40.46 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  44.59 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  41.24 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  39.47 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  38.98 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  38.64 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  42.42 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.33 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  37.43 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  40.74 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  40.22 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  40.45 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  35.59 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  40.45 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  41.28 
 
 		 254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  40.45 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  36.32 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.99 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.99 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  38.34 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  38.98 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  40 
 
 		 213 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  39.77 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  39.39 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  41.07 
 
 		 205 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  36.36 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  36.18 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.57 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  40.61 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.39 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.03 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.6 
 
 		 182 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  41.36 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  35.5 
 
 		 182 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  39.52 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.79 
 
 		 237 aa  121  6e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.41 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  38.15 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  35.67 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  37.95 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  32.97 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  39.11 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  38.1 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  37.08 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  39.11 
 
 		 197 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  38.76 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  34.68 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  37.14 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.72 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  34.97 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  35.93 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  43.21 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.79 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  38.92 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  35.29 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  36.72 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  35.71 
 
 		 196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  33.15 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  35.59 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  31.55 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  36.42 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  39.18 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  37.95 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  36.9 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  31.61 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.64 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.94 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.37 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  38.66 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  38.66 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>