226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3276 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
295 aa  608  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  58.5 
 
 
291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.34 
 
 
294 aa  335  5e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  55.89 
 
 
292 aa  324  9e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  51.71 
 
 
294 aa  301  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  38.58 
 
 
203 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  38.07 
 
 
203 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  36.79 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3148  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 
219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  33.82 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  36.46 
 
 
211 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  36.32 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  35.29 
 
 
201 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.3 
 
 
203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  39.15 
 
 
205 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  34.05 
 
 
200 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  35.48 
 
 
202 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  34.21 
 
 
200 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  39.15 
 
 
208 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  36.32 
 
 
209 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  37.23 
 
 
221 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  37.57 
 
 
205 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43240  hypothetical protein  36.41 
 
 
202 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.531737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  36.17 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  36.17 
 
 
208 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  36.7 
 
 
208 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  36.51 
 
 
205 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2654  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
203 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2915  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
203 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  37.7 
 
 
209 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  36.22 
 
 
208 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.11 
 
 
197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  36.17 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  33.66 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  35.26 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  33.81 
 
 
210 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  32.16 
 
 
228 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  38.22 
 
 
201 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  35.32 
 
 
210 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  33.85 
 
 
221 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  35.64 
 
 
207 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2914  hypothetical protein  33.86 
 
 
203 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  37.57 
 
 
201 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4410  hypothetical protein  34.03 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  37.23 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1051  flavin reductase-like, FMN-binding  30.7 
 
 
213 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0886076 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5370  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.53 
 
 
223 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.480853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  36.7 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5906  hypothetical protein  31.41 
 
 
195 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  36.11 
 
 
287 aa  109  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  32.47 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5134  hypothetical protein  32.43 
 
 
220 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  35.48 
 
 
212 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  35.64 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 
219 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0090  flavin reductase domain-containing protein  31.03 
 
 
210 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00316855 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0364  nitrilotriacetate monooxygenase component B  31.88 
 
 
205 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  33.82 
 
 
207 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.52 
 
 
199 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.64 
 
 
203 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.11 
 
 
209 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5253  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.97 
 
 
196 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.504075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1365  hypothetical protein  31.41 
 
 
196 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300021  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2740  hypothetical protein  27.8 
 
 
203 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5124  flavin reductase-like, FMN-binding  31.09 
 
 
216 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.178532 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7599  hypothetical protein  31.35 
 
 
220 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  36.69 
 
 
202 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2683  hypothetical protein  27.8 
 
 
203 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  36.7 
 
 
209 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  32.99 
 
 
203 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  34.57 
 
 
202 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  34.04 
 
 
230 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  31.28 
 
 
209 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0075  hypothetical protein  32.12 
 
 
196 aa  103  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000447764  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  35.45 
 
 
201 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  33.51 
 
 
207 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  35.45 
 
 
209 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  34.57 
 
 
206 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  31.96 
 
 
208 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.69 
 
 
217 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  32.81 
 
 
201 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 
241 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  30.15 
 
 
201 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  32.8 
 
 
209 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02124  hypothetical protein  33.14 
 
 
169 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.14 
 
 
216 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  32.45 
 
 
209 aa  99.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  31.61 
 
 
201 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  32.45 
 
 
210 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  32.45 
 
 
209 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  29.65 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.45 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.65 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>