173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3250 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
651 aa  1352    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.03 
 
 
643 aa  414  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.36 
 
 
728 aa  359  8e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.9 
 
 
722 aa  352  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.7 
 
 
664 aa  279  9e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.3 
 
 
905 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.6 
 
 
553 aa  167  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.4 
 
 
765 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.63 
 
 
762 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
529 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.65 
 
 
613 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.53 
 
 
605 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 
821 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  29.26 
 
 
777 aa  157  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  25.6 
 
 
816 aa  156  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.74 
 
 
688 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.99 
 
 
683 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.51 
 
 
760 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  26.68 
 
 
602 aa  152  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.29 
 
 
549 aa  151  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.95 
 
 
533 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.54 
 
 
609 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.12 
 
 
613 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.15 
 
 
634 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.3 
 
 
422 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.72 
 
 
775 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.34 
 
 
618 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.8 
 
 
858 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.5 
 
 
500 aa  143  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.47 
 
 
834 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.87 
 
 
534 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.64 
 
 
790 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.66 
 
 
774 aa  142  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.64 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 
811 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  27.22 
 
 
558 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.37 
 
 
812 aa  140  7e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.34 
 
 
546 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.81 
 
 
795 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  28.53 
 
 
795 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.67 
 
 
812 aa  139  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.61 
 
 
665 aa  139  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.07 
 
 
785 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 
628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.83 
 
 
525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.29 
 
 
797 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 
515 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  26.67 
 
 
639 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.23 
 
 
584 aa  137  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  27.49 
 
 
736 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.61 
 
 
852 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.4 
 
 
505 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.35 
 
 
779 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  24.2 
 
 
637 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.64 
 
 
794 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.75 
 
 
528 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.08 
 
 
526 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.96 
 
 
820 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.71 
 
 
781 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.3 
 
 
533 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 
655 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 
676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.55 
 
 
447 aa  130  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  31.99 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
863 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.64 
 
 
688 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.57 
 
 
534 aa  127  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.61 
 
 
766 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.78 
 
 
542 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.13 
 
 
469 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.01 
 
 
525 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 
866 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.85 
 
 
527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.08 
 
 
636 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  30.77 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.5 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.33 
 
 
807 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.45 
 
 
857 aa  122  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.07 
 
 
772 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.93 
 
 
1140 aa  122  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.17 
 
 
547 aa  121  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  26.92 
 
 
776 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.32 
 
 
779 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.2 
 
 
481 aa  120  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.51 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.67 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.72 
 
 
504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  28.16 
 
 
543 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.78 
 
 
636 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.12 
 
 
545 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  27.05 
 
 
639 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.8 
 
 
518 aa  114  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.23 
 
 
868 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0050  N,N'-diacetylchitobiase precursor (chitobiase)  30.83 
 
 
881 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.89 
 
 
673 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.85 
 
 
627 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  29.23 
 
 
883 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.66 
 
 
639 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
888 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>