63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3237 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  46.12 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  49.38 
 
 		 244 aa  223  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  46.75 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  47.77 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  47.77 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  45.65 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  43.72 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  36.18 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  38.59 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  36.63 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  38.27 
 
 		 244 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  38.84 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  35.8 
 
 		 244 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  37.04 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  38.37 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  35.8 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  36.36 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  42.01 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.59 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  37.72 
 
 		 972 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  35.39 
 
 		 998 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  36.52 
 
 		 964 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  34.83 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  33.33 
 
 		 977 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  28.86 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  28.91 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.1 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.02 
 
 		 891 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  30.04 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  92  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  31.28 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  31.2 
 
 		 270 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  28.57 
 
 		 770 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  33.73 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29.44 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  29.27 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  29.37 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 768 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.55 
 
 		 748 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  28.75 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  32.97 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.46 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  29.63 
 
 		 736 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  30.32 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.23 
 
 		 767 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  31.5 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 384 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  31.67 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  28.75 
 
 		 911 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 322 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>