More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3058 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
837 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  62.52 
 
 
742 aa  934    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  63.28 
 
 
767 aa  931    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6644  copper-translocating P-type ATPase  66.58 
 
 
753 aa  996    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.935468  normal  0.257295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  47 
 
 
753 aa  667    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 
759 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  47.66 
 
 
747 aa  644    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  64.54 
 
 
741 aa  946    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  46.7 
 
 
743 aa  653    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  66.3 
 
 
754 aa  993    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 
759 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  48.54 
 
 
752 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
831 aa  669    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  46.93 
 
 
750 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1499  cation-transporting ATPase; copper-exporting ATPase  63.98 
 
 
804 aa  917    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.037718  normal  0.0386539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 
740 aa  1497    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  47.22 
 
 
797 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  46.44 
 
 
815 aa  655    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  45.39 
 
 
786 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  63.09 
 
 
748 aa  940    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  45.7 
 
 
837 aa  630  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
836 aa  629  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  44.18 
 
 
814 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
818 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  45.15 
 
 
837 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 
889 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  45.04 
 
 
889 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  45.91 
 
 
805 aa  617  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
797 aa  616  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
798 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.94 
 
 
794 aa  613  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
828 aa  610  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  43.39 
 
 
826 aa  611  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0270  copper-translocating P-type ATPase  45.36 
 
 
748 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  43.59 
 
 
742 aa  610  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.07 
 
 
827 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  45.74 
 
 
860 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 
885 aa  607  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  44.77 
 
 
836 aa  607  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00355  Cation transport ATPase  44.86 
 
 
782 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  44.5 
 
 
750 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  46.32 
 
 
758 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  43.45 
 
 
828 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  43.76 
 
 
828 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  48.2 
 
 
735 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  44.46 
 
 
894 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  45.39 
 
 
942 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  44.4 
 
 
758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  46.04 
 
 
805 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  42.26 
 
 
805 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.88 
 
 
821 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
737 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  45.76 
 
 
805 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  45.76 
 
 
805 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  47.53 
 
 
823 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
759 aa  596  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  43.56 
 
 
760 aa  597  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 
817 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
837 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  46.52 
 
 
755 aa  598  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  43.66 
 
 
792 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.63 
 
 
805 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  45.91 
 
 
805 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  46.19 
 
 
735 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.63 
 
 
805 aa  594  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
838 aa  593  1e-168  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  46.18 
 
 
803 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 
806 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
802 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  44.43 
 
 
747 aa  591  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2356  hypothetical protein  47.33 
 
 
736 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  45.27 
 
 
833 aa  592  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  45.82 
 
 
806 aa  591  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
806 aa  592  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 
724 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
802 aa  592  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  43.95 
 
 
792 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  45.37 
 
 
787 aa  590  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  46.95 
 
 
804 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  43.5 
 
 
824 aa  585  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  44.89 
 
 
798 aa  588  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  44.55 
 
 
742 aa  586  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  44.14 
 
 
740 aa  585  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  45.21 
 
 
724 aa  586  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 
857 aa  588  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  44.89 
 
 
798 aa  588  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
835 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 
855 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  43.43 
 
 
778 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  42.18 
 
 
954 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  47.16 
 
 
795 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 
786 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  44.22 
 
 
852 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.51 
 
 
839 aa  580  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
762 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 
833 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.28 
 
 
762 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5724  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 
839 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.788276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 
839 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  47.12 
 
 
793 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>