25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3055 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3055  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.242531  decreased coverage  0.000503951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3064  hypothetical protein  39.82 
 
 		 283 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1506  cation-transporting ATPase  50 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000147666  normal  0.111213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3324  hypothetical protein  43.52 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.943882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1532  cation-transporting ATPase  34.55 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00495755  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1677  Heavy metal transport/detoxification protein  39.64 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5685  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 773 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0785655  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1452  heavy metal transport/detoxification protein  37.61 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  37.27 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1516  Heavy metal transport/detoxification protein  34.82 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0275841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 1087 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6226  Heavy metal transport/detoxification protein  31.9 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.18 
 
 		 954 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  34.38 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 802 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 889 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 889 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  33.87 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 760 aa  41.6  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 751 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 826 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 838 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>