80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3043 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1007    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  44.12 
 
 		 497 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  42.47 
 
 		 490 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  39.57 
 
 		 392 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.69 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  36.72 
 
 		 351 aa  233  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  29.33 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  23.22 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.04 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.04 
 
 		 606 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.62 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.62 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  32.5 
 
 		 821 aa  60.1  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.25 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.73 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  27.5 
 
 		 541 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.73 
 
 		 599 aa  55.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.31 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3879  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.71 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.55 
 
 		 585 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  34.52 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.52 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.92 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.63 
 
 		 378 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  30.39 
 
 		 840 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.19 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.25 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  28.07 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.07 
 
 		 559 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.67 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  27.55 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.35 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.57 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.25 
 
 		 382 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.7 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  31.87 
 
 		 382 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.14 
 
 		 376 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.5 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.17 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  27.66 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  26.59 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.42 
 
 		 388 aa  47  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.32 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  27.5 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.43 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.06 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  26.26 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.97 
 
 		 376 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.17 
 
 		 380 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  28 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  26.26 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.95 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.39 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.21 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1977  hypothetical protein  25.49 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.86 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.87 
 
 		 848 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0782  hypothetical protein  28.43 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.84486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.03 
 
 		 557 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.97 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.86 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0370379 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  27.82 
 
 		 381 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  24.86 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.19 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.13 
 
 		 344 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.64 
 
 		 381 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.01 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.2 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.29 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.01 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  26.77 
 
 		 344 aa  43.5  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.28 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>