62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2984 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  49.43 
 
 
718 aa  682    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  100 
 
 
722 aa  1487    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  43.7 
 
 
704 aa  618  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  42.02 
 
 
714 aa  526  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  40.88 
 
 
714 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  40.59 
 
 
721 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  39.12 
 
 
712 aa  491  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  36.43 
 
 
720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  32.43 
 
 
718 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  32.43 
 
 
718 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  32.3 
 
 
718 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  32.43 
 
 
718 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  33.24 
 
 
731 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  31.98 
 
 
725 aa  350  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  32.37 
 
 
707 aa  350  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  34.2 
 
 
720 aa  350  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  32.56 
 
 
716 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  31.94 
 
 
718 aa  347  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  31.81 
 
 
718 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  31.71 
 
 
721 aa  345  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  31.81 
 
 
718 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  32.08 
 
 
718 aa  345  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  31.38 
 
 
718 aa  343  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  32.14 
 
 
716 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  31.94 
 
 
718 aa  342  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  32.56 
 
 
718 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  31.64 
 
 
718 aa  342  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  31.17 
 
 
718 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  31.72 
 
 
718 aa  340  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  31.56 
 
 
718 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  31.63 
 
 
738 aa  335  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  30.5 
 
 
743 aa  326  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  30.18 
 
 
732 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  30.33 
 
 
739 aa  321  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  29.85 
 
 
734 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  29.63 
 
 
732 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  29.4 
 
 
732 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  30.69 
 
 
731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  29.68 
 
 
732 aa  308  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  29.55 
 
 
732 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  29.09 
 
 
732 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.95 
 
 
732 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  29.05 
 
 
732 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  29.45 
 
 
732 aa  303  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  29.33 
 
 
729 aa  301  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  29.44 
 
 
715 aa  302  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  28.01 
 
 
740 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  29.05 
 
 
732 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  29 
 
 
941 aa  282  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  27.86 
 
 
767 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  32.56 
 
 
786 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  27.77 
 
 
710 aa  204  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  28.02 
 
 
711 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  26.5 
 
 
751 aa  189  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  25.21 
 
 
706 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  24.64 
 
 
688 aa  158  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  34.16 
 
 
713 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  30 
 
 
701 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  31.66 
 
 
706 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  30.8 
 
 
706 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  29.1 
 
 
759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  28.09 
 
 
714 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>