79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2887 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  100 
 
 		 658 aa  1356    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  59.48 
 
 		 677 aa  804    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  50.2 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  48.72 
 
 		 535 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  48.39 
 
 		 532 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  40.57 
 
 		 533 aa  416  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  36.56 
 
 		 407 aa  230  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  33.41 
 
 		 471 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  32.86 
 
 		 399 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  33.26 
 
 		 408 aa  210  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  34.83 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  32.07 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  33.89 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  32.53 
 
 		 535 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 		 604 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  31.4 
 
 		 568 aa  186  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  31.12 
 
 		 411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.45 
 
 		 548 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.71 
 
 		 693 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.44 
 
 		 541 aa  183  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  33.99 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.61 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.95 
 
 		 583 aa  177  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.13 
 
 		 547 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.53 
 
 		 589 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  28.6 
 
 		 446 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  27.92 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  31.32 
 
 		 441 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  29.33 
 
 		 631 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  28.95 
 
 		 558 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  27.44 
 
 		 640 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  27.13 
 
 		 737 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  30.73 
 
 		 727 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  27.23 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  33.14 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  30.17 
 
 		 574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  29.18 
 
 		 850 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  29.11 
 
 		 445 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  27.36 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  26.65 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  29.52 
 
 		 636 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  26 
 
 		 612 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  27.15 
 
 		 427 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  25.06 
 
 		 450 aa  120  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  25.39 
 
 		 440 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  25.69 
 
 		 424 aa  116  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  27.67 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  24.76 
 
 		 442 aa  114  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  27.54 
 
 		 320 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  23.99 
 
 		 435 aa  99.4  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  25.45 
 
 		 469 aa  90.5  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  27.27 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  31.06 
 
 		 970 aa  75.9  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  31.62 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  37.84 
 
 		 812 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  33.62 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  34.53 
 
 		 1193 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.54 
 
 		 1172 aa  61.6  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3814  glycoside hydrolase family 31  30.83 
 
 		 1119 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1869 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  28.17 
 
 		 1206 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38 
 
 		 887 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  31.16 
 
 		 1193 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  27.54 
 
 		 1069 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.01 
 
 		 1295 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  31.58 
 
 		 1392 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  37.88 
 
 		 1991 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  34.69 
 
 		 3563 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0156  glycosyl hydrolase family 31 protein  26.87 
 
 		 1108 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0105603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  39.02 
 
 		 2802 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_45442  predicted protein  31.53 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000628338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  25.35 
 
 		 1236 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  30.36 
 
 		 2142 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.78 
 
 		 1424 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  22.08 
 
 		 938 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1469  glycoside hydrolase family 31  26.84 
 
 		 527 aa  45.8  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000732278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  25 
 
 		 734 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  32.58 
 
 		 824 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  41.67 
 
 		 1626 aa  43.9  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>