44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2839 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2839  glycosyl hydrolase family 88  100 
 
 		 404 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00286392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2694  glycosyl hydrolase family 88  47.93 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000585774  hitchhiker  0.00821463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4097  glycosyl hydrolase family 88  39.81 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6823  glycosyl hydrolase family 88  49.23 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155971  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3864  glycosyl hydrolase family 88  46.33 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2238  glycosyl hydrolase family 88  40.73 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  0.825384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0551  glycosyl hydrolase family 88  49.24 
 
 		 397 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4196  glycosy hydrolase family protein  39.5 
 
 		 396 aa  289  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1296  glycosyl hydrolase family 88  39.9 
 
 		 414 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0790  glycosyl hydrolase family 88  42.05 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3866  glycosyl hydrolase family 88  42.15 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0129916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1019  glycosyl hydrolase family 88  44.6 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000263626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3963  glycosyl hydrolase family 88  42.68 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0599446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2649  glycosyl hydrolase family 88  39.95 
 
 		 392 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2845  glycosyl hydrolase family 88  42.7 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0713509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2830  glycosyl hydrolase family 88  39.2 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0365381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0960  glycosyl hydrolase family 88  43.29 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.155523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2406  glycosy hydrolase family protein  40.06 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.270482  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0316  glycosy hydrolase family protein  37.95 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0776  glycosy hydrolase family protein  33.53 
 
 		 364 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7344  Unsaturated glucuronyl hydrolase  31.75 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5334  glycosyl hydrolase family 88  28.68 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5051  glycosyl hydrolase family 88  31.04 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0288  glycosy hydrolase family protein  32.46 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0400  putative glucuronyl hydrolase  34 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3433  glycosy hydrolase family protein  30.12 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0396  glucuronyl hydrolase  33.71 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1901  glucuronyl hydrolase  33.13 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0842468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3029  glycosy hydrolase family protein  30.15 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0127  glycosyl hydrolase family 88  32.42 
 
 		 394 aa  152  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0934  glycosy hydrolase family protein  30.65 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.304704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3952  glycosyl hydrolase family 88  31.43 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0349  unsaturated glucuronyl hydrolase  31 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3416  glycosyl hydrolase family 88  30.06 
 
 		 400 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1855  glycosy hydrolase family protein  27.53 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244626  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03991  glucuronyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05090)  25.89 
 
 		 489 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811003  normal  0.852927 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11078  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.157022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3789  hypothetical protein  27.06 
 
 		 488 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3737  hypothetical protein  29.89 
 
 		 493 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2836  hypothetical protein  22.93 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.643664  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6429  glycosy hydrolase family protein  23.64 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2883  glycosy hydrolase family protein  24.31 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4761  glycosy hydrolase family protein  22.8 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.377925  normal  0.0133001 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04629  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>