284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2782 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  37.46 
 
 
987 aa  667  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  43.9 
 
 
951 aa  790  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  64.64 
 
 
920 aa  1259  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
920 aa  1912  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  29.64 
 
 
1019 aa  242  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  26.91 
 
 
1455 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  27.46 
 
 
1084 aa  239  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
1084 aa  232  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  25.6 
 
 
1112 aa  232  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  27.78 
 
 
1020 aa  223  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  25.95 
 
 
1129 aa  223  1e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  27.84 
 
 
1024 aa  222  2e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.22 
 
 
1264 aa  223  2e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  9.54733e-05  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  29.73 
 
 
1035 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.81 
 
 
1033 aa  218  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.58 
 
 
1036 aa  215  2e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  25.11 
 
 
1076 aa  214  5e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.7 
 
 
992 aa  210  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  25.33 
 
 
1030 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  25.33 
 
 
1030 aa  209  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.08 
 
 
1018 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.75 
 
 
1053 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  31.25 
 
 
992 aa  207  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.15 
 
 
1026 aa  207  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.22 
 
 
1030 aa  207  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.22 
 
 
1030 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.11 
 
 
1030 aa  206  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.4 
 
 
1030 aa  206  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 
1049 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  25.11 
 
 
1030 aa  203  1e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.78 
 
 
1030 aa  202  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  28.84 
 
 
1063 aa  202  2e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.15 
 
 
1289 aa  199  1e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 
1077 aa  200  1e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
1043 aa  199  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 
1079 aa  199  2e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.33 
 
 
1003 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  28.67 
 
 
1043 aa  197  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  26.38 
 
 
1045 aa  195  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.24 
 
 
1033 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  25.46 
 
 
1059 aa  192  3e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  7.51059e-10 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  29.69 
 
 
1035 aa  188  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 
1045 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.85 
 
 
1041 aa  186  2e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.43 
 
 
1046 aa  184  5e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.8 
 
 
1013 aa  184  5e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.14 
 
 
1041 aa  183  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  23.91 
 
 
1108 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  27.33 
 
 
1028 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.20353e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  28.45 
 
 
1003 aa  182  3e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.38 
 
 
996 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  22.82 
 
 
1017 aa  178  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  26.78 
 
 
1164 aa  176  1e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.28 
 
 
1030 aa  177  1e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  26.3 
 
 
1026 aa  175  3e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  24.69 
 
 
1030 aa  175  4e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  27.11 
 
 
1036 aa  175  4e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  25.63 
 
 
1029 aa  174  6e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  27.45 
 
 
1023 aa  174  6e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  28.38 
 
 
1024 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.67859e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  24.5 
 
 
1005 aa  172  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.35 
 
 
1044 aa  172  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  25.46 
 
 
1036 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.6 
 
 
1424 aa  171  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  23.79 
 
 
1032 aa  171  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  29.32 
 
 
1023 aa  169  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  25.31 
 
 
1024 aa  168  6e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.44327e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  25.31 
 
 
1024 aa  167  6e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.19694e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  31.1 
 
 
803 aa  167  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  28.18 
 
 
1024 aa  166  2e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.41482e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  27.79 
 
 
1024 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.75259e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  27.79 
 
 
1024 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.6518e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.49 
 
 
968 aa  164  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.79 
 
 
1024 aa  164  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  8.77394e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.84 
 
 
1329 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  27.59 
 
 
1024 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.45928e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  24.49 
 
 
1008 aa  161  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  24.43 
 
 
1030 aa  161  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.48 
 
 
1004 aa  160  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  22.71 
 
 
1032 aa  158  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  25.75 
 
 
1050 aa  158  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  24.73 
 
 
1012 aa  158  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  25.75 
 
 
1066 aa  158  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  25.59 
 
 
1066 aa  158  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  32.28 
 
 
750 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.0433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  25 
 
 
1043 aa  157  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  24.44 
 
 
1043 aa  157  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  23.08 
 
 
1021 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  28.18 
 
 
1020 aa  153  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 
1022 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  30 
 
 
824 aa  152  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4074  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 
806 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 
1094 aa  151  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  27.84 
 
 
781 aa  150  1e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  30.67 
 
 
743 aa  150  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  29.31 
 
 
804 aa  149  2e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  28.49 
 
 
1031 aa  149  2e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.61 
 
 
781 aa  148  4e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 
640 aa  145  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  30.09 
 
 
928 aa  145  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>