177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2718 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
779 aa  1618    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.39 
 
 
634 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.73 
 
 
790 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.24 
 
 
766 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.49 
 
 
905 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.01 
 
 
605 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.6 
 
 
613 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.64 
 
 
655 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 
609 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.97 
 
 
762 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.19 
 
 
618 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.81 
 
 
795 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.82 
 
 
618 aa  389  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.76 
 
 
542 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.25 
 
 
533 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.73 
 
 
613 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.5 
 
 
553 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  32.05 
 
 
777 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  35.79 
 
 
795 aa  360  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.88 
 
 
765 aa  360  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.74 
 
 
774 aa  360  7e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.63 
 
 
772 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  36.3 
 
 
736 aa  352  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.49 
 
 
775 aa  351  3e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.33 
 
 
760 aa  351  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.73 
 
 
776 aa  348  2e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 
781 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.4 
 
 
785 aa  347  5e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.71 
 
 
526 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.89 
 
 
812 aa  334  4e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.76 
 
 
779 aa  333  8e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  36.24 
 
 
639 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.71 
 
 
812 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 
534 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.21 
 
 
549 aa  321  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  37.07 
 
 
639 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.39 
 
 
529 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.77 
 
 
821 aa  310  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.72 
 
 
834 aa  309  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  38.26 
 
 
602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.79 
 
 
505 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.41 
 
 
527 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 
534 aa  296  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 
637 aa  293  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  36.44 
 
 
469 aa  293  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.59 
 
 
627 aa  289  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.64 
 
 
481 aa  285  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.25 
 
 
549 aa  284  4.0000000000000003e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.81 
 
 
547 aa  276  7e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.36 
 
 
636 aa  275  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.21 
 
 
546 aa  271  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.94 
 
 
665 aa  267  5.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.88 
 
 
636 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.95 
 
 
639 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.49 
 
 
628 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  36.02 
 
 
639 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
584 aa  258  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.45 
 
 
688 aa  256  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 
858 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.98 
 
 
545 aa  254  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.6 
 
 
593 aa  253  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.49 
 
 
673 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.27 
 
 
673 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.65 
 
 
683 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.38 
 
 
688 aa  247  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.17 
 
 
866 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.97 
 
 
422 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.37 
 
 
525 aa  237  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.34 
 
 
515 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  33.04 
 
 
543 aa  235  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.71 
 
 
533 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.38 
 
 
1140 aa  234  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.33 
 
 
614 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.19 
 
 
811 aa  231  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.7 
 
 
868 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.49 
 
 
558 aa  230  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.61 
 
 
794 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.99 
 
 
797 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.93 
 
 
676 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.17 
 
 
852 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.33 
 
 
528 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  30.87 
 
 
525 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 
820 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 
504 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.63 
 
 
816 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.3 
 
 
863 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 
493 aa  210  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 
807 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.34 
 
 
857 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.07 
 
 
447 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.21 
 
 
884 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.79 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  30.7 
 
 
889 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.02 
 
 
888 aa  195  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 
853 aa  193  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.02 
 
 
888 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.17 
 
 
906 aa  191  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.93 
 
 
900 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  27.81 
 
 
896 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>