31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2705 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2705  PilT protein domain protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000855121  normal  0.254585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1065  PilT protein domain protein  45.52 
 
 		 136 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.912654  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3133  PilT protein domain protein  41.41 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4381  PilT domain-containing protein  43.85 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2858  Nucleotide binding protein PINc  42.11 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2280  Nucleotide binding protein PINc  40.44 
 
 		 141 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0719969  hitchhiker  0.0001006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2217  Nucleotide binding protein PINc  40.44 
 
 		 141 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2323  Nucleotide binding protein PINc  41.98 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98566e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1712  Nucleotide binding protein PINc  38.06 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.103374  hitchhiker  0.0042604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0652  hypothetical protein  37.88 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000285816  hitchhiker  0.0000013741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0308  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0425  nucleic acid binding protein  41.54 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1868  PilT protein domain protein  31.62 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1423  PilT domain-containing protein  33.9 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3100  Nucleotide binding protein PINc  31.88 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3766  hypothetical protein  33.59 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2655  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0924  nucleic acid binding protein  24.64 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.269416  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2180  PilT protein domain protein  30.88 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.18775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1157  hypothetical protein  26.43 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0851306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0491  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2332  hypothetical protein  33.8 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3888  protein of unknown function DUF132  31.85 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1139  nucleotide binding protein, PINc  29.71 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0629  nucleic acid binding protein  26.43 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.837014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3147  hypothetical protein  38.06 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.372503  normal  0.192106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0727  hypothetical protein  41.82 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1382  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0719  PilT protein domain protein  44.68 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0435665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0679  hypothetical protein  29.55 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000243663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>