16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2692 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1050    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  43.98 
 
 		 582 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  24.8 
 
 		 790 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1840  hypothetical protein  25 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000982396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2787  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1037 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.595004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4192  hypothetical protein  36.03 
 
 		 544 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4090  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1061 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.872685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2687  hypothetical protein  26.83 
 
 		 508 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  23.83 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2150  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1043 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2831  hypothetical protein  22.53 
 
 		 535 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776559  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  21.96 
 
 		 564 aa  54.7  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1501  hypothetical protein  37.84 
 
 		 583 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  35.62 
 
 		 559 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3444  hypothetical protein  27.85 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.623137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3618  hypothetical protein  32.08 
 
 		 547 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.216975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>