179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2638 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  59.84 
 
 
618 aa  777    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
613 aa  1274    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.63 
 
 
762 aa  555  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.81 
 
 
553 aa  542  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.38 
 
 
795 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  46.27 
 
 
777 aa  521  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.42 
 
 
790 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.55 
 
 
542 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  51.11 
 
 
905 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  49.71 
 
 
613 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.99 
 
 
766 aa  495  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.62 
 
 
779 aa  495  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.35 
 
 
772 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.44 
 
 
775 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.09 
 
 
774 aa  482  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.07 
 
 
605 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.86 
 
 
634 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  41.83 
 
 
795 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.87 
 
 
609 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.13 
 
 
533 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  43.85 
 
 
736 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.17 
 
 
785 aa  442  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  41.43 
 
 
776 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.59 
 
 
618 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.11 
 
 
526 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.97 
 
 
781 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.72 
 
 
655 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.76 
 
 
812 aa  428  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.27 
 
 
812 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.91 
 
 
765 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.99 
 
 
821 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.39 
 
 
549 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.14 
 
 
527 aa  395  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.78 
 
 
834 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.77 
 
 
534 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.82 
 
 
760 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.44 
 
 
505 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.73 
 
 
779 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.65 
 
 
534 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 
546 aa  353  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.95 
 
 
469 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.02 
 
 
665 aa  339  9e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.85 
 
 
549 aa  333  8e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  36.42 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.32 
 
 
422 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.39 
 
 
628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  38.03 
 
 
614 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 
547 aa  313  5.999999999999999e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 
637 aa  312  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 
529 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.62 
 
 
525 aa  310  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.14 
 
 
481 aa  310  6.999999999999999e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.71 
 
 
639 aa  309  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.52 
 
 
639 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  35.51 
 
 
543 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  33.87 
 
 
558 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.91 
 
 
545 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 
683 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.88 
 
 
447 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  31.18 
 
 
816 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.81 
 
 
688 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.42 
 
 
688 aa  278  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.08 
 
 
525 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 
639 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.84 
 
 
636 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.95 
 
 
627 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.1 
 
 
794 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.5 
 
 
584 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.2 
 
 
858 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.66 
 
 
515 aa  267  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.2 
 
 
636 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.27 
 
 
797 aa  263  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.71 
 
 
593 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.5 
 
 
528 aa  256  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.48 
 
 
504 aa  256  1.0000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.7 
 
 
518 aa  254  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.29 
 
 
493 aa  254  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.78 
 
 
639 aa  253  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.18 
 
 
673 aa  248  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.4 
 
 
533 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.35 
 
 
673 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.65 
 
 
820 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.7 
 
 
676 aa  238  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
811 aa  236  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.14 
 
 
852 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.21 
 
 
1140 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.36 
 
 
857 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.78 
 
 
807 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 
866 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.68 
 
 
863 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  35.04 
 
 
778 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.58 
 
 
868 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 
500 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.81 
 
 
530 aa  201  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.46 
 
 
489 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  29.6 
 
 
889 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05690  N-acetyl-beta-hexosaminidase  29.05 
 
 
476 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.2 
 
 
888 aa  185  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 
888 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.77 
 
 
910 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>