74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2589 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  809    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  42.15 
 
 		 490 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  39.57 
 
 		 490 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.16 
 
 		 497 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.14 
 
 		 384 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  36.45 
 
 		 351 aa  199  9e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.03 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.37 
 
 		 606 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  37.37 
 
 		 606 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.25 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.45 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.58 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.87 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.54 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.17 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.26 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 500 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.38 
 
 		 615 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28380  Zinc carboxypeptidase  20.54 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.66 
 
 		 262 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.6 
 
 		 406 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.25 
 
 		 599 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 		 541 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  34.26 
 
 		 840 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.41 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.54 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.24 
 
 		 848 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  26.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  26.82 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  26.26 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  26.26 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.23 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  27.33 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.53 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  29 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  24.3 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.68 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.36 
 
 		 848 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.19 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  25 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.16 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.63 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  27.1 
 
 		 259 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.52 
 
 		 384 aa  46.2  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  36.96 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  24.31 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.84 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  27.01 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.97 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  32.97 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  30.16 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.37 
 
 		 382 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  24.84 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.36 
 
 		 845 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.98 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.67 
 
 		 837 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2122  hypothetical protein  28.47 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.66 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 		 862 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  29.63 
 
 		 241 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.29 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.66 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.84 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  26 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>