More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2588 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2588  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
931 aa  1910    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0841472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2337  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.3 
 
 
918 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225496  normal  0.289664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.1 
 
 
1001 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.76 
 
 
982 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1394  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.23 
 
 
944 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.4092  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1355  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.21 
 
 
944 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2979  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.31 
 
 
931 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3465  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.26 
 
 
943 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32 
 
 
944 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00257397  hitchhiker  0.00000788258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1369  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.97 
 
 
944 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0132501  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1287  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.47 
 
 
941 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000172415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 
938 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00727633  normal  0.0393451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2790  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.08 
 
 
938 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00120618  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2889  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.14 
 
 
938 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00315446  decreased coverage  0.00000356203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3317  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.28 
 
 
957 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.13719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2778  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.55 
 
 
955 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2422  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.02 
 
 
942 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0305723  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2759  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.88 
 
 
937 aa  429  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000369969  normal  0.171772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2560  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.89 
 
 
989 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.08 
 
 
868 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126138  normal  0.134869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1539  hypothetical protein  38.62 
 
 
529 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3942  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.36 
 
 
864 aa  359  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0662737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3200  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.4 
 
 
861 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.469727  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0025  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.84 
 
 
838 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0133  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.83 
 
 
880 aa  348  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0041  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.18 
 
 
882 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0054  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.01 
 
 
641 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4612  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.24 
 
 
870 aa  276  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3218  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.88 
 
 
822 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3037  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.87 
 
 
847 aa  258  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3558  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.37 
 
 
870 aa  234  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.22 
 
 
845 aa  220  8.999999999999998e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.45 
 
 
822 aa  128  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1754  hypothetical protein  24.36 
 
 
841 aa  121  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.22 
 
 
824 aa  120  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0284  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.01 
 
 
686 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2116  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.54 
 
 
648 aa  98.6  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.577161  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  23.62 
 
 
652 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.3 
 
 
692 aa  98.6  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.96 
 
 
680 aa  98.6  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
692 aa  97.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0153  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.54 
 
 
654 aa  95.9  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.96 
 
 
677 aa  94.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.83 
 
 
660 aa  94.7  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.62 
 
 
688 aa  94  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  22.78 
 
 
655 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  22.78 
 
 
654 aa  92  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.55 
 
 
910 aa  92  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  25.65 
 
 
652 aa  92  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  22.78 
 
 
654 aa  92  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
675 aa  92  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  24.34 
 
 
655 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.15 
 
 
631 aa  91.3  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2940  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.48 
 
 
689 aa  90.5  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000010034  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  24.54 
 
 
655 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  24.16 
 
 
654 aa  89.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.18 
 
 
691 aa  89.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3938  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.47 
 
 
681 aa  89.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3813  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.23 
 
 
681 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.38 
 
 
652 aa  87.8  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4254  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 
698 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0158  prolyl oligopeptidase family protein  24.16 
 
 
655 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0211  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.89 
 
 
673 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.692132 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4128  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.89 
 
 
673 aa  87  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.658271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1672  hypothetical protein  25.23 
 
 
691 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000600124  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0209  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.11 
 
 
698 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0582441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3740  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.75 
 
 
681 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.93 
 
 
686 aa  85.1  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  21.84 
 
 
708 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.32 
 
 
697 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3407  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.63 
 
 
680 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3412  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.92 
 
 
690 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0581677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4957  hypothetical protein  25 
 
 
693 aa  84.3  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1987  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.78 
 
 
813 aa  84.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537  peptidase, putative  23.75 
 
 
675 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.47 
 
 
681 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2242  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 
807 aa  80.9  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140093  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1753  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.55 
 
 
673 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1251  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.44 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.92 
 
 
741 aa  79.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  25.93 
 
 
698 aa  79  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0990  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.82 
 
 
840 aa  79  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.15 
 
 
670 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.44 
 
 
667 aa  78.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0490  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.94 
 
 
675 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0816  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.83 
 
 
665 aa  78.2  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000784893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1823  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.35 
 
 
633 aa  77.8  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.272231  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1208  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.17 
 
 
849 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0757015  hitchhiker  0.0025212 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1722  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.16 
 
 
762 aa  77.8  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0100  hypothetical protein  23.9 
 
 
656 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.338515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5739  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.09 
 
 
735 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  24.91 
 
 
656 aa  74.7  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.64 
 
 
666 aa  74.7  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.73 
 
 
620 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0272535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0810  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.69 
 
 
719 aa  73.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0412357  normal  0.0214856 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  26.26 
 
 
648 aa  73.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  24.54 
 
 
656 aa  72.8  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1099  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.62 
 
 
858 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00716839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  32.79 
 
 
729 aa  72.8  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0755  peptidase, putative  24.12 
 
 
688 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>