More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2577 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  68.49 
 
 		 240 aa  354  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  69.7 
 
 		 236 aa  349  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  68.75 
 
 		 228 aa  343  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  70.27 
 
 		 226 aa  338  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  68.78 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  68.33 
 
 		 244 aa  325  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  65.79 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  64.57 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  64 
 
 		 236 aa  308  8e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  63.56 
 
 		 228 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  63.56 
 
 		 227 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  63.23 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  61.11 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  62.78 
 
 		 229 aa  295  4e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  60.18 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  60.89 
 
 		 228 aa  293  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  60.54 
 
 		 233 aa  292  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  59.73 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  56.43 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  59.07 
 
 		 246 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  59.28 
 
 		 237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  56.41 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  59.29 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 224 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 230 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  58.82 
 
 		 230 aa  279  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 		 224 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 224 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  58.74 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 229 aa  276  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  59.73 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  53.63 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  57.85 
 
 		 224 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  54.47 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  57.4 
 
 		 224 aa  275  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  58.3 
 
 		 224 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  56.09 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  53.57 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 228 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  53.57 
 
 		 253 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  56 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  54.36 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  56.95 
 
 		 266 aa  271  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  51.44 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  56.11 
 
 		 239 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  51.6 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  56.6 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  56.17 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  56.76 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  56.17 
 
 		 241 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  55.36 
 
 		 232 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  55.2 
 
 		 241 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  56.56 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  55.36 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.05 
 
 		 224 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.87 
 
 		 228 aa  268  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  57.26 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  56.56 
 
 		 225 aa  265  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 238 aa  264  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  55.16 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.26 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  54.87 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  52.16 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  55.19 
 
 		 236 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  55.96 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  53.39 
 
 		 291 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 		 228 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  55.96 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  56.22 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 228 aa  260  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  56.05 
 
 		 235 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  54.79 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  54.79 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  53.15 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  54.75 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  54.75 
 
 		 234 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  50.64 
 
 		 652 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  54.55 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  55 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  54.95 
 
 		 238 aa  258  7e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  53.18 
 
 		 248 aa  258  8e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 		 235 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  53.42 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  54.46 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  52.49 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  51.06 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  60 
 
 		 235 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  56.5 
 
 		 236 aa  255  5e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  51.93 
 
 		 658 aa  255  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  50.21 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>