More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2542 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6954  acriflavin resistance protein  45.45 
 
 		 1066 aa  854    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254025 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1935  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.21 
 
 		 1013 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2542  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1006 aa  2031    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00165713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2035  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  35.43 
 
 		 1008 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1699  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1008 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.460189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2193  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1016 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0307  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1056 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641909  normal  0.615822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0788  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1019 aa  554  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0308  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1018 aa  542  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0251334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0349  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1014 aa  418  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0783  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1015 aa  401  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1011 aa  379  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  27.79 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  27.51 
 
 		 1023 aa  370  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1050 aa  364  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  27 
 
 		 1071 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  25.56 
 
 		 1045 aa  361  5e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  27 
 
 		 1032 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1704  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1032 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2043  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  28.14 
 
 		 1032 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1034 aa  350  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  28.41 
 
 		 1070 aa  343  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.51 
 
 		 1061 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  28.41 
 
 		 1070 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  27.01 
 
 		 1072 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  27.09 
 
 		 1041 aa  341  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  26.94 
 
 		 1043 aa  341  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  26.92 
 
 		 1038 aa  340  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  26.4 
 
 		 1070 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  26.4 
 
 		 1070 aa  340  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  26.4 
 
 		 1070 aa  340  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  28.31 
 
 		 1070 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  26.67 
 
 		 1040 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  26.46 
 
 		 1034 aa  339  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  27.49 
 
 		 1062 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.11 
 
 		 1092 aa  337  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  26.31 
 
 		 1070 aa  337  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  25.94 
 
 		 1066 aa  335  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  25.48 
 
 		 1066 aa  334  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  26.89 
 
 		 1077 aa  334  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  26.23 
 
 		 1047 aa  333  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  25.78 
 
 		 1028 aa  333  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1043 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.54 
 
 		 1034 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  27.36 
 
 		 1076 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  26.83 
 
 		 1037 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.41 
 
 		 1034 aa  332  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  27.25 
 
 		 1082 aa  331  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  26.29 
 
 		 1040 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  23.25 
 
 		 1017 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.39 
 
 		 1034 aa  330  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  26.29 
 
 		 1049 aa  330  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1043 aa  330  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  23.25 
 
 		 1017 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  27.41 
 
 		 1075 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1044 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  25.83 
 
 		 1070 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.25 
 
 		 1017 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  27.68 
 
 		 1060 aa  328  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  23.95 
 
 		 1047 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  26.21 
 
 		 1065 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  27.1 
 
 		 1069 aa  328  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  26.83 
 
 		 1074 aa  327  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  23.15 
 
 		 1017 aa  327  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  25.07 
 
 		 1034 aa  327  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  25.46 
 
 		 1064 aa  327  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  27.04 
 
 		 1056 aa  327  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  26.15 
 
 		 1077 aa  327  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  26.26 
 
 		 1047 aa  327  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00305  Heavy metal efflux pump CzcA  27.19 
 
 		 1048 aa  327  9e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  26.15 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  26.24 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  26.24 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  26.24 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  26.15 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  26.24 
 
 		 1077 aa  326  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  26.35 
 
 		 1060 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.56 
 
 		 1053 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  26.22 
 
 		 1039 aa  324  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  25.9 
 
 		 1024 aa  323  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  26.35 
 
 		 1076 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1040 aa  323  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.91 
 
 		 1017 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  25.66 
 
 		 1062 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  26.69 
 
 		 1066 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  25.24 
 
 		 1083 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  27.78 
 
 		 1075 aa  322  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  26.35 
 
 		 1036 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  26.01 
 
 		 1075 aa  321  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2300  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.33 
 
 		 1070 aa  321  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00374  putative RND efflux system protein  26.82 
 
 		 1035 aa  320  7e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  25.1 
 
 		 1052 aa  320  9e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  26.22 
 
 		 1043 aa  320  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  23.31 
 
 		 1017 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  25.02 
 
 		 1083 aa  319  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  27.66 
 
 		 1068 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  26.23 
 
 		 1070 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  24.69 
 
 		 1047 aa  317  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  25.99 
 
 		 1037 aa  317  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  27.66 
 
 		 1068 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>