More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2498 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 770 aa  1573    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 780 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 703 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 		 696 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 682 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 680 aa  269  1e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  27.54 
 
 		 762 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 688 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 690 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 688 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 675 aa  213  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 680 aa  197  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 715 aa  194  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 691 aa  187  8e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  27.1 
 
 		 706 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  27.1 
 
 		 706 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 731 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  27.1 
 
 		 721 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.96 
 
 		 706 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.96 
 
 		 706 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 701 aa  177  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 700 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  25.72 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.72 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 700 aa  165  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 678 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 694 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 723 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.96 
 
 		 727 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 726 aa  151  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 709 aa  150  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 705 aa  144  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 742 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 742 aa  144  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.26 
 
 		 681 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 692 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 736 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 701 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 734 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.33 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 757 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 678 aa  134  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 681 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 697 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 723 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.68 
 
 		 743 aa  125  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 681 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 690 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 705 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 698 aa  120  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 688 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 706 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  24.06 
 
 		 690 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 714 aa  117  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  24.07 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 710 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.11 
 
 		 712 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 716 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 664 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 713 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  23.88 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 736 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 718 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 717 aa  101  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 715 aa  101  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 733 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 700 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 702 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 757 aa  94.7  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 711 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 791 aa  89.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 785 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  21.68 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 720 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  21.24 
 
 		 787 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0896  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 775 aa  81.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  19.77 
 
 		 740 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  21.39 
 
 		 798 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  23.02 
 
 		 646 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 700 aa  77.4  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.36 
 
 		 653 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  20.73 
 
 		 786 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1085 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23 
 
 		 712 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.58 
 
 		 723 aa  75.5  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.89 
 
 		 703 aa  74.3  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 809 aa  73.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>