More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2454 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  53.36 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3534  two-component system response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1332  response regulator receiver  38.91 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0720  DNA-binding response regulator  40.54 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2732  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0465  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.84 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 229 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1449  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.01 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.01 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  37.84 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.01 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.05 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 221 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  37.17 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.84 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  36.94 
 
 		 219 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 235 aa  157  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 221 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 652 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  36.49 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  37.73 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.73 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3158  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2540  response regulator receiver  38.7 
 
 		 231 aa  154  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  37.84 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.39 
 
 		 222 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0800  response regulator receiver  39.91 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.271408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1614  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0238  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.82 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.84 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6964  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.043471  normal  0.107802 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  36.32 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  37.5 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  39.01 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 224 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  36 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>