More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2429 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2429  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00087995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  33.04 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1712  multidrug resistance transporter, Bcr family  34.19 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  32.38 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1285  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 469 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1832  major facilitator superfamily drug efflux protein  27.42 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3983  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5744  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3808  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150016  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4560  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4447  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0049  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.79 
 
 		 424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02683  hypothetical protein  26.04 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0115  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.2 
 
 		 391 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2067  multidrug resistance protein D  27.67 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0252383  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.07 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0269  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.36 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4576  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.6 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.857973  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_1896  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.17 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.29 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.29 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5334  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.35 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.76 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.68 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1240  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.98 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000341384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.35 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.11 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.74 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.3 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.25 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.52 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.33 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.87 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0777  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.01 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.74 
 
 		 411 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.14 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.49 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.14 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.91 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.74 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.95 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1329  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.91 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00139075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1271  multidrug resistance transporter, Bcr family  31.91 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0103038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.88 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  33.93 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  25.52 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.81 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.66 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.01 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.38 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2360  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.93 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.470045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.3 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.25 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.3 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.99 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.66 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.72 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.25 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1784  inner membrane transport protein YdhC  27.52 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.79 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0211544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1947  tcaB protein  29.26 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.26 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  27.42 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3304  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  34.13 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.22 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.33 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0145  multidrug resistance protein D  25 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.9 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0527  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.76 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.88 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.31 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2800  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.96 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2999  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.32 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.827266  normal  0.0320436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.88 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.21 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 394 aa  99.4  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
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NC_007348  Reut_B4448  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.18 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1038  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.69 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.614321  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1035  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.69 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2421  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.81 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0451  putative MFS transporter  27.65 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.892159 
 
 
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NC_011205  SeD_A4187  multidrug resistance protein D  26.35 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.48 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_000830  multidrug resistance protein D  24.12 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131991  n/a   
 
 
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NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.42 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.27 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
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