More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2405 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
175 aa  355  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  44.6 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  41.48 
 
 
236 aa  111  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  42.03 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40.58 
 
 
229 aa  107  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  44.2 
 
 
229 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 
263 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.34 
 
 
233 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 
229 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 
225 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 
209 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.17 
 
 
205 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 
229 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.02 
 
 
218 aa  98.6  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.68 
 
 
229 aa  98.6  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 
296 aa  97.4  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40 
 
 
260 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.67 
 
 
230 aa  96.3  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40 
 
 
260 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  40.3 
 
 
264 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  46.02 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.7 
 
 
224 aa  95.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 
163 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  43.08 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 
360 aa  93.6  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  42.61 
 
 
342 aa  93.2  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 
403 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  32.6 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
219 aa  92  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  36.2 
 
 
459 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 
218 aa  91.3  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  47.17 
 
 
320 aa  90.9  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 
222 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
219 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 
218 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
163 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  44.25 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
206 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
221 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.36 
 
 
218 aa  89  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 
263 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.02 
 
 
294 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
206 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.36 
 
 
218 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.57 
 
 
263 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  45.13 
 
 
223 aa  88.6  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.37 
 
 
542 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  36.81 
 
 
261 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 
263 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 
162 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.84 
 
 
215 aa  87.4  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 
213 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
543 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.02 
 
 
212 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
242 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 
262 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  38.21 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
209 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 
544 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
288 aa  85.9  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.34 
 
 
261 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  40.18 
 
 
212 aa  85.5  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.69 
 
 
226 aa  85.5  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 
223 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 
498 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.34 
 
 
261 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.39 
 
 
1987 aa  85.1  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  34.33 
 
 
222 aa  85.1  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
227 aa  85.5  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.54 
 
 
209 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.67 
 
 
248 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.5 
 
 
286 aa  84.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.74 
 
 
210 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.74 
 
 
210 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
261 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  35.25 
 
 
331 aa  84.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
456 aa  84.3  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  35.25 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  48.31 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  39.47 
 
 
607 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 
1755 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.2 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  36.9 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  32.8 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 
623 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  33.09 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.29 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>