More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2361 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  100 
 
 
418 aa  854  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  61.96 
 
 
429 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  33.65 
 
 
417 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  31.16 
 
 
412 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  33.17 
 
 
422 aa  190  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  30.72 
 
 
407 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  30.02 
 
 
431 aa  178  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  30.79 
 
 
446 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.61 
 
 
475 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  26 
 
 
419 aa  156  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  28.7 
 
 
465 aa  149  1e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  27.23 
 
 
436 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  26.12 
 
 
503 aa  122  1e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  27.32 
 
 
400 aa  122  2e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.40238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  26.54 
 
 
495 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  26.96 
 
 
394 aa  118  2e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  23.98 
 
 
503 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  40 
 
 
490 aa  114  2e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  26.62 
 
 
516 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.8172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.44 
 
 
391 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.33 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.48 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  23.93 
 
 
381 aa  85.9  1e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.08 
 
 
428 aa  84.7  3e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  24.05 
 
 
382 aa  83.2  8e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  22.47 
 
 
398 aa  80.5  5e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.46 
 
 
398 aa  80.5  5e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.43 
 
 
397 aa  80.1  8e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  25.06 
 
 
420 aa  79  1e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  22.54 
 
 
438 aa  79.7  1e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  22.27 
 
 
438 aa  79.3  1e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  23.06 
 
 
438 aa  79.3  1e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  23.53 
 
 
441 aa  77.8  4e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.44 
 
 
440 aa  76.6  7e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.86 
 
 
456 aa  76.3  9e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.86 
 
 
456 aa  76.3  9e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  22.82 
 
 
427 aa  75.9  1e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  31.25 
 
 
397 aa  76.3  1e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  23.86 
 
 
456 aa  76.3  1e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.53 
 
 
374 aa  75.1  2e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.45 
 
 
375 aa  74.7  3e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  21.77 
 
 
427 aa  74.7  3e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.16 
 
 
382 aa  74.7  3e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  26.82 
 
 
410 aa  74.3  4e-12  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  21.53 
 
 
427 aa  73.9  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  21.53 
 
 
427 aa  73.9  5e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  31.69 
 
 
405 aa  73.9  5e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  33.54 
 
 
394 aa  73.6  6e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  21.73 
 
 
428 aa  73.6  6e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  21.53 
 
 
427 aa  73.6  6e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.75 
 
 
404 aa  72.8  1e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  22.76 
 
 
412 aa  72.4  1e-11  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.77 
 
 
455 aa  72.4  1e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  32.14 
 
 
387 aa  72.4  1e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
382 aa  70.9  4e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  32.77 
 
 
530 aa  70.5  6e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  35.71 
 
 
420 aa  70.5  6e-11  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  21.12 
 
 
396 aa  69.7  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  32.67 
 
 
534 aa  68.2  2e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.42 
 
 
430 aa  68.6  2e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  21.53 
 
 
427 aa  67.8  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  20.24 
 
 
379 aa  67.4  4e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  24.03 
 
 
400 aa  67  6e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.39 
 
 
373 aa  66.6  9e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  21.85 
 
 
433 aa  65.9  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.39 
 
 
372 aa  66.2  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  31.58 
 
 
382 aa  66.2  1e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.66 
 
 
366 aa  65.9  1e-09  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  29.03 
 
 
610 aa  65.5  2e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23.04 
 
 
399 aa  65.5  2e-09  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.94 
 
 
405 aa  64.7  3e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  32.17 
 
 
458 aa  64.7  3e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.39 
 
 
388 aa  64.3  3e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  36.43 
 
 
404 aa  63.9  4e-09  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  28.77 
 
 
372 aa  64.3  4e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  22.96 
 
 
399 aa  64.3  4e-09  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  27.24 
 
 
387 aa  63.5  6e-09  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.01 
 
 
372 aa  63.2  1e-08  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  24.78 
 
 
377 aa  62.4  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  32.03 
 
 
509 aa  62.4  1e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  29.19 
 
 
370 aa  62.8  1e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  34.13 
 
 
538 aa  61.6  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.6 
 
 
453 aa  62  2e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  24.58 
 
 
426 aa  61.6  2e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  26.51 
 
 
491 aa  62  2e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  33.91 
 
 
379 aa  62.4  2e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  21.85 
 
 
424 aa  61.6  3e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27.56 
 
 
378 aa  61.2  4e-08  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  31.21 
 
 
481 aa  60.8  4e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  24.27 
 
 
417 aa  60.8  4e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  33.09 
 
 
328 aa  61.2  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  31.82 
 
 
449 aa  61.2  4e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  34.38 
 
 
332 aa  60.5  6e-08  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  23.42 
 
 
379 aa  60.1  7e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  31.91 
 
 
405 aa  60.1  7e-08  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  22.47 
 
 
379 aa  60.1  8e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  35.71 
 
 
478 aa  59.7  9e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  37.86 
 
 
327 aa  59.7  9e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  36.46 
 
 
409 aa  59.7  1e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>