More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2272 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  83.72 
 
 		 489 aa  817    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 479 aa  975    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  41.54 
 
 		 432 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  40.67 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 430 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 430 aa  325  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  37.47 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 426 aa  320  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  38.94 
 
 		 430 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 430 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  39.03 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 424 aa  279  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 445 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  33.97 
 
 		 480 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 441 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  34.18 
 
 		 439 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  33.33 
 
 		 442 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  33.97 
 
 		 439 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  33.76 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 442 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 441 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 457 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 449 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  35.32 
 
 		 441 aa  242  9e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 435 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 441 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  31.38 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  28.16 
 
 		 424 aa  179  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 420 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  26.83 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  26.83 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  26.83 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  26.83 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  26.83 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  28.28 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  25.58 
 
 		 432 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.92 
 
 		 432 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  26.54 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  25.79 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  26.54 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  25.63 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  27.41 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  27.34 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  25.37 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  25.37 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  25.37 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  25.37 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  25.37 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 443 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 435 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 423 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 423 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  25.82 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  24.83 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  25.46 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  25.82 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  25.18 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>