213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2230 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 
594 aa  1241    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  74.66 
 
 
593 aa  966    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  57.05 
 
 
593 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  38.16 
 
 
624 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  39.93 
 
 
595 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  37.93 
 
 
593 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  37.96 
 
 
620 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  38.72 
 
 
640 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  37.97 
 
 
606 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  37.06 
 
 
598 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  36.8 
 
 
657 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  38.42 
 
 
593 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  37.37 
 
 
595 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  37.65 
 
 
618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  35.91 
 
 
599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  36.27 
 
 
598 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  36.97 
 
 
606 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  36.86 
 
 
597 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  36.86 
 
 
597 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  36.97 
 
 
606 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  37.02 
 
 
596 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  36.95 
 
 
603 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  37.73 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  35.58 
 
 
589 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  38.14 
 
 
592 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  35.67 
 
 
598 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  34.48 
 
 
594 aa  357  3.9999999999999996e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  34.37 
 
 
612 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  32.95 
 
 
612 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  32.73 
 
 
613 aa  312  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  32.88 
 
 
611 aa  309  9e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  32.83 
 
 
602 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  32.66 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  33.61 
 
 
599 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  32.43 
 
 
596 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2741  glycoside hydrolase 15-related protein  31.58 
 
 
625 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  32.36 
 
 
600 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  32.14 
 
 
599 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  31.17 
 
 
621 aa  296  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  33.22 
 
 
613 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  31.42 
 
 
594 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2739  glycoside hydrolase 15-related  32.71 
 
 
868 aa  289  8e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  32.62 
 
 
610 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2805  glycoside hydrolase 15-related  31.07 
 
 
606 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  31.23 
 
 
645 aa  283  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  31.49 
 
 
596 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  31.56 
 
 
595 aa  283  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  31.21 
 
 
617 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  31.53 
 
 
665 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  31.48 
 
 
586 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  29.92 
 
 
635 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  31.86 
 
 
610 aa  281  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4753  glycoside hydrolase 15-related  30.23 
 
 
617 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392129  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3218  glycoside hydrolase 15-related protein  30.33 
 
 
629 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0740  glycoside hydrolase 15-related  30.92 
 
 
594 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000780754 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  30.55 
 
 
593 aa  280  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  31.24 
 
 
597 aa  280  7e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  30.83 
 
 
617 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  31.65 
 
 
602 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  31.14 
 
 
603 aa  279  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  30.41 
 
 
619 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  29.97 
 
 
627 aa  276  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  30.72 
 
 
617 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  31.29 
 
 
609 aa  276  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  31.24 
 
 
609 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  31.64 
 
 
609 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  30.29 
 
 
627 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  31.04 
 
 
598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  30.95 
 
 
611 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  30.61 
 
 
599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  30.81 
 
 
850 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  30.85 
 
 
627 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  30.63 
 
 
600 aa  273  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  31 
 
 
626 aa  273  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  30.1 
 
 
626 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  31.99 
 
 
625 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  30.12 
 
 
605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  31.21 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  31.19 
 
 
596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  29.32 
 
 
605 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  30.92 
 
 
609 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1490  glycoside hydrolase 15-related  31.43 
 
 
894 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  30.22 
 
 
602 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  31.83 
 
 
623 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12430  hypothetical protein  30.56 
 
 
642 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  31.02 
 
 
619 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  32.47 
 
 
639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  31.08 
 
 
609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  31.08 
 
 
609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  31.71 
 
 
601 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  29.7 
 
 
636 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  29.83 
 
 
605 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  30.85 
 
 
619 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  30.92 
 
 
624 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>